结论：员工入职当天生病，用人单位不可以扣社保，这种做法是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《社会保险法》第五十八条规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。

员工入职当天，就已经与用人单位建立了劳动关系，属于“用工之日”的范畴。用人单位有义务在规定时间内为员工办理社保登记并缴纳社保费用，不能因为员工入职当天生病就扣除社保，否则就违反了上述法律规定。

从员工权益角度

社保是员工应享有的基本权益，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。这些保险制度旨在保障员工在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

员工入职当天生病，此时更需要医疗保险等社保的保障来支付医疗费用。如果用人单位扣除社保，会损害员工享受社保待遇的权益，使员工在面临疾病等风险时无法得到应有的保障。

从用人单位责任角度

用人单位为员工缴纳社保是其法定的社会责任和义务。这不仅关系到员工的切身利益，也关系到社会的稳定和公平。如果用人单位随意扣除员工社保，不仅会面临法律风险，还可能影响企业的声誉和形象，不利于企业的长期发展。

如果用人单位存在扣除员工社保的行为，员工可以向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门会依法进行调查处理，责令用人单位改正，并可能对用人单位处以相应的罚款。员工也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

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