针对您提出的“老板加工烟纸，员工怎么处理”这一问题，这实际上涉及到了烟草专卖管理的相关法律法规以及员工在此类情况下的应对策略。以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，烟草制品的生产、销售和进出口都受到严格的法律管控。在中国，只有获得烟草专卖生产企业许可证的企业才能合法生产烟草制品，包括烟纸。如果老板未经许可擅自加工烟纸，这属于违法行为，可能会面临法律制裁。

对于员工而言，面对老板加工烟纸的情况，应当采取以下措施：

1. 了解法律法规：

   • 员工应首先了解国家关于烟草专卖管理的相关法律法规，明确加工烟纸是否合法，以及非法加工可能带来的法律后果。

2. 评估风险：

   • 员工需要评估自己参与非法加工活动的风险，包括可能面临的法律责任、职业声誉损害以及未来就业的影响等。

3. 采取行动：

   • 拒绝参与：如果员工确认加工烟纸是非法行为，应坚决拒绝参与，并避免与老板进行任何形式的合作或协助。
   • 报告相关部门：员工可以向当地的烟草专卖局、市场监督管理局或公安机关报告老板的非法加工行为，提供相关证据和信息，以便相关部门进行调查和处理。
   • 保护自身权益：在报告过程中，员工应注意保护自己的个人信息和安全，避免受到报复或威胁。

4. 寻求法律援助：

   • 如果员工因拒绝参与非法加工活动而受到老板的威胁或报复，可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

5. 关注后续处理：

   • 员工可以关注相关部门的处理结果，了解老板是否受到法律制裁，以及自己是否因此受到任何影响。

此外，从您提供的参考信息中，我们可以看到烟草公司对罚没卷烟纸的处置方式，通常是按照国家烟草专卖局、财政部的相关规定进行变卖或销毁。这进一步说明了烟草制品的生产和销售受到严格监管，非法加工烟纸是不被允许的。

综上所述，面对老板加工烟纸的情况，员工应坚决拒绝参与非法活动，及时报告相关部门，并保护好自己的合法权益。同时，员工也应增强法律意识，了解并遵守国家关于烟草专卖管理的相关法律法规。