结论：员工患癌症医疗期满申请劳动仲裁期间，工资是否会中断取决于多种因素，但通常情况下，在医疗期内及医疗期满后的合理期间内，工资不应被随意中断。
一、医疗期内的工资支付
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依据该法第四十条（无过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，在医疗期内，员工的就业权益受到法律的严格保护，工资支付也应得到保障。
工资支付义务：
- 在医疗期内，用人单位应按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者支付病假工资或者疾病救济费。病假工资或者疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
二、医疗期满后的工资支付
医疗期满后的处理：
- 医疗期满后，如果员工仍然无法胜任原工作，用人单位应首先尝试为员工安排其他适合的工作岗位。如果员工能够胜任新岗位，工资支付应按照新岗位的工资标准执行。
- 如果员工确实无法胜任任何由用人单位安排的工作，用人单位可以依据《劳动合同法》第四十条第一项的规定，在提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后，解除劳动合同，并需支付相应的经济补偿。但在解除劳动合同前，工资仍应继续支付。
申请劳动仲裁期间的工资：
- 如果员工在医疗期满后申请劳动仲裁，且仲裁请求涉及工资支付问题，那么在仲裁期间，除非双方另有约定或法律另有规定，否则用人单位应继续支付工资。这是因为仲裁期间，劳动关系仍然存在，且工资支付是劳动关系的核心内容之一。
三、特殊情况下的工资支付
协商一致解除劳动合同：
- 如果员工与用人单位协商一致解除劳动合同，并就工资支付等问题达成一致意见，那么工资支付应按照双方协商的结果执行。
用人单位违法解除劳动合同：
- 如果用人单位在医疗期内或医疗期满后违法解除劳动合同，员工有权要求继续履行劳动合同或者要求用人单位支付赔偿金。在赔偿金计算中，工资支付是一个重要因素。如果用人单位未支付工资或未足额支付工资，赔偿金计算时应予以考虑。
四、建议与注意事项
保留证据：
- 员工应保留好与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录等，以便在申请劳动仲裁或提起诉讼时证明自己的主张。
及时咨询：
- 如果员工对工资支付问题有疑问或遇到纠纷，应及时向专业律师咨询，了解自己的合法权益和维权途径。
注意仲裁时效：
- 员工申请劳动仲裁时，应注意仲裁时效问题。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
总结：员工患癌症医疗期满申请劳动仲裁期间，工资是否会中断取决于多种因素。但通常情况下，在医疗期内及医疗期满后的合理期间内，工资不应被随意中断。如果员工遇到工资支付问题或纠纷，应及时向专业律师咨询并寻求法律援助。