结论：在工厂受伤但工伤尚未认定，且工厂停止运营的情况下，您仍然可以通过一系列法律途径来维护自己的合法权益，包括及时收集证据、申请工伤认定、进行劳动能力鉴定以及要求赔偿。

详细分析：

1. 及时收集证据：

   • 劳动关系证明：尽管工厂停止运营，但您仍需收集能够证明与工厂存在劳动关系的材料，如劳动合同、工资支付凭证、工作证、考勤记录等。
   • 工伤证据：包括医疗机构出具的诊断证明书、病历、现场目击证人证言、现场监控视频或照片等，以证明工伤的发生及伤情。

2. 申请工伤认定：

   • 申请时限：根据《工伤保险条例》的规定，用人单位应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内提出工伤认定申请。若用人单位未按规定申请，工伤职工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内直接向当地社会保险行政部门提出申请。
   • 申请材料：准备工伤认定申请表、劳动关系证明材料、工伤相关证据等。
   • 特别提示：即使工厂未为员工参加工伤保险，您仍有权向劳动保障行政部门申请工伤认定，并要求工厂承担相应责任。在工厂停止运营的情况下，这一步骤尤为重要，因为它是后续维权的基础。

3. 进行劳动能力鉴定：

   • 申请条件：经治疗伤情相对稳定后存在残疾或影响劳动能力的，您或您的用人单位应及时向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。
   • 申请材料：包括劳动能力鉴定申请表、工伤认定决定书、完整病历材料等。
   • 鉴定流程：劳动能力鉴定委员会将组织专家进行鉴定，并在规定时间内作出结论。这一结论将作为您要求赔偿的重要依据。

4. 要求赔偿：

   • 赔偿项目：根据工伤认定决定书和劳动能力鉴定结论，您可以计算出应得的赔偿金额，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴、一次性伤残补助金等。
   • 协商与仲裁：首先尝试与工厂（或其负责人、继承人等）进行协商，要求支付赔偿。若协商不成，您可向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。在工厂停止运营的情况下，您可能需要通过法律程序来追讨赔偿，如申请法院强制执行工厂的财产或要求工厂的负责人、继承人等承担赔偿责任。

额外建议：

• 保留证据：在整个维权过程中，务必保留好所有与工伤有关的证据，以备不时之需。
• 寻求法律援助：面对复杂的法律程序和可能的法律纠纷，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以获取更准确的法律建议和更有效的维权指导。

可能遇到的挑战及应对：

• 工厂无财产可执行：如果工厂确实没有财产可供执行，您可能需要考虑其他途径来追讨赔偿，如要求工厂的负责人、继承人等承担赔偿责任（如果适用的话），或者通过其他法律手段来追讨。
• 法律程序复杂：面对复杂的法律程序，您可能会感到困惑和无助。此时，寻求专业律师的帮助将是非常有益的，我可以为您提供专业的法律建议和指导，帮助您顺利度过难关。

总之，尽管工厂停止运营给您的维权带来了一定的困难，但您仍然可以通过及时收集证据、申请工伤认定、进行劳动能力鉴定以及要求赔偿等步骤来维护自己的合法权益。如果您在维权过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。