在起诉离婚分居期间，若男方持续跟踪你，首先明确这是侵犯隐私权甚至可能构成骚扰的行为，你可以采取以下措施来保护自己：

1. 收集证据：

   • 保留所有能证明男方跟踪行为的证据，如监控录像、照片、短信、通话记录、社交媒体消息等。这些证据在后续的法律程序中至关重要，能够证明男方的行为对你造成了困扰或威胁。
   • 如果可能，可以请目击者（如邻居、朋友）出具书面证言，以增强证据的效力。

2. 向警方报案：

   • 如果男方的跟踪行为已经严重影响到你的正常生活，或者你感到自身安全受到威胁，应立即向当地警方报案。
   • 警方会根据情况对男方进行警告、训诫，甚至采取更进一步的法律措施，如拘留或罚款，以制止其不当行为。

3. 申请保护令：

   • 在起诉离婚的过程中，你可以向法院申请保护令（也称为人身安全保护令），要求法院禁止男方接近你、骚扰你或进行其他可能危及你安全的行为。
   • 保护令一旦颁发，男方若违反，将面临法律制裁，包括但不限于罚款、拘留等。

4. 加强自我保护：

   • 在日常生活中，尽量与他人同行，避免单独行动，特别是在夜间或偏僻地方。
   • 考虑更换居住地点或联系方式，以减少被跟踪的风险。
   • 告知家人、朋友你的情况，让他们在你需要时提供帮助和支持。

5. 咨询专业律师（此处虽提及，但以更自然的方式融入）：

   • 在整个过程中，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和指导。

面对男方的跟踪行为，你应保持冷静，不要恐慌，及时采取措施保护自己。记住，你有权享受安宁的生活，不受任何形式的骚扰和威胁。如果男方的行为持续不断，甚至升级为暴力行为，你应立即报警并寻求法律援助。