元旦当天夜班且工作时间跨越24点的，超过24点后的工作时间通常算三倍工资。具体分析如下：
- 法定节假日的认定：元旦作为法定节假日，其工资支付标准受《中华人民共和国劳动法》第四十四条的明确规范。根据该条款，法定节假日安排劳动者工作的，需支付不低于工资300%的工资报酬。此规定不区分白班或夜班，仅以法定假日当天为计算基准。
- 跨24点工作时间的计算：若劳动者在元旦当天（如1月1日0时至24时）从事夜班工作，整个班次均属于法定节假日工作时间，用人单位应按三倍工资标准支付全部工时报酬。即使工作时间跨越自然日（如1月1日20时至1月2日8时），1月1日24时后的工作时间仍属于法定假日的延续，仍需按三倍工资计算。
- 特殊情形排除：若用人单位已通过调休方式安排劳动者在元旦当天休息，则该日不产生三倍工资义务。但需注意，法定节假日不可通过补休替代加班费，此情形仅适用于休息日加班。
实务建议：
- 劳动者可要求用人单位在工资条中单独列明法定节假日加班工资项目，并保留考勤记录作为维权证据。
- 若用人单位主张跨日夜班中仅部分时段属于法定假日，劳动者可依据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》要求用人单位提供工时划分依据。
- 争议解决途径：可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，主张支付差额工资及25%经济补偿金（依据《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条，虽该办法部分条款废止，但仲裁实践中仍可能参照适用）。