结论：公司在一审、二审均败诉后申请再审且仍不支付款项，您可通过申请强制执行、关注再审进展、收集恶意诉讼证据等途径维护自身权益。以下为具体分析：
一、申请再审不影响原判决效力，您可申请强制执行
- 再审程序性质：再审是针对已生效判决的特殊救济程序，其启动并不直接导致原判决中止执行。根据《民事诉讼法》第213条，除非法院裁定中止执行，否则原判决仍具有执行力。因此，您有权依据二审生效判决向法院申请强制执行。
- 强制执行流程：
- 提交申请：向一审法院（或财产所在地法院）提交强制执行申请书，附上生效判决书、执行申请书、身份证明等材料。
- 法院审查：法院将在7日内审查并决定是否立案，立案后向被执行人（公司）发出执行通知。
- 执行措施：若公司仍不履行，法院可采取查封、扣押、冻结财产、限制高消费、纳入失信被执行人名单等措施，甚至对公司法定代表人采取司法拘留等强制手段。
二、关注再审进展，防范恶意诉讼
- 再审审查期限：法院应在收到再审申请后3个月内审查完毕，符合条件的裁定再审，不符合的裁定驳回。您可通过法院官网或联系承办法官查询案件进展。
- 恶意诉讼风险：若公司申请再审无合理理由，仅为拖延履行，可能构成恶意诉讼。您可收集证据（如公司无新证据、反复申请再审等），向法院提出异议，要求驳回再审申请并追究公司责任。
三、若再审改判，需根据新判决处理
- 改判可能性：再审可能维持原判、改判或发回重审。若改判公司无需支付款项，您需停止执行并返还已执行财产（如有）。但此情形概率较低，因一审、二审均已支持您的诉求。
- 改判后的救济：若您认为再审判决错误，可依据《民事诉讼法》第216条申请检察监督（抗诉或检察建议），但此为终局救济途径，需谨慎使用。
四、其他建议
- 协商调解：在执行过程中，您可与公司协商分期履行或以物抵债等方案，以尽快实现权益。若公司同意，可签订书面协议并申请法院确认。
- 法律援助：若您经济困难，可向当地法律援助中心申请法律援助，由律师协助处理执行及再审相关事宜。
行动建议：立即向法院申请强制执行，并密切关注再审进展。若公司存在恶意诉讼行为，及时向法院提出异议。如有需要，可直接向我咨询具体操作细节。