若合同到期自动续约条款有效且员工因此申请仲裁，企业需根据具体仲裁请求准备应诉材料；若条款无效或存在争议，企业可能面临支付经济补偿等风险，需结合实际情况处理。以下为详细分析：

1. 合同到期自动续约条款的效力认定

   • 条款有效情形：若劳动合同中明确约定了“合同到期自动续约”的条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，也不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，那么该条款是有效的。在此情况下，员工申请仲裁主张未续签劳动合同的双倍工资等请求，一般不会得到支持。企业需准备劳动合同、续约条款等相关证据，以证明双方已就续约达成合意。

   • 条款无效或存在争议情形：若劳动合同中的自动续约条款存在模糊不清、显失公平或违反法律法规等情形，或者员工能够证明其在签订劳动合同时对该条款存在误解或受到欺诈、胁迫等，那么该条款可能被认定为无效或存在争议。在此情况下，员工申请仲裁主张相关权益，企业可能面临支付经济补偿、双倍工资等风险。企业需根据具体情况，准备反驳证据，如员工签字确认的劳动合同、续约通知等，以证明自身无过错。

2. 员工仲裁请求的应对策略

   • 针对未续签劳动合同的双倍工资请求：若企业能够证明双方已就续约达成合意，且劳动合同中的自动续约条款有效，那么企业可以拒绝支付双倍工资。若条款存在争议或无效，企业需评估自身过错程度，考虑与员工协商解决或准备应诉材料。

   • 针对经济补偿请求：若员工以企业未依法续签劳动合同为由主张经济补偿，企业需根据《劳动合同法》的相关规定，评估自身是否应支付经济补偿。若企业无过错，可以拒绝支付；若企业存在过错，如未提前通知员工续约、未与员工协商续约条件等，那么企业可能需支付经济补偿。

3. 预防与应对措施

   • 完善劳动合同条款：企业在制定劳动合同时，应明确约定续约条件、续约期限等关键条款，避免使用模糊不清或显失公平的表述。同时，应确保劳动合同的签订、续签等程序符合法律法规的规定。

   • 加强员工沟通与协商：在劳动合同到期前，企业应主动与员工沟通续约事宜，了解员工的意愿和需求，协商续约条件。若员工不同意续约或提出异议，企业应及时处理并记录相关情况。

   • 准备应诉材料与策略：若员工申请仲裁，企业应积极准备应诉材料，包括劳动合同、续约通知、员工签字确认的文件等。同时，应制定应诉策略，明确答辩要点和反驳证据，以维护自身合法权益。

在处理此类纠纷时，企业应保持冷静、理性，积极与员工沟通协商，寻求和解或调解解决。若无法达成一致，企业应及时寻求法律帮助，准备应诉材料，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。