结论：法院判决用人单位与劳动者形成劳动关系，并不违反法律规定，而是基于事实和法律进行的正确裁决。
分析说明：
劳动关系的认定依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，劳动关系的认定主要依据双方是否存在事实上的劳动行为、是否接受用人单位的管理、是否由用人单位支付劳动报酬等因素。
- 法院在审理此类案件时，会综合考虑双方提供的证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等，以判断双方是否存在劳动关系。
用人单位起诉确认不形成劳动关系的法律性质：
- 用人单位起诉确认不形成劳动关系，实际上是对劳动关系存在与否的一种争议表达。这种争议需要通过法律程序进行裁决，以确定双方的法律关系。
- 法院作为中立的第三方，会根据事实和法律进行裁决，如果认定双方存在劳动关系，则判决形成劳动关系，这是法院的法定职责，并不违反法律规定。
法院判决形成劳动关系的合法性：
- 法院判决形成劳动关系，是基于对事实和法律的准确理解和适用。如果法院认为双方存在劳动关系，那么判决形成劳动关系是合法的，也是必要的。
- 这种判决有助于保护劳动者的合法权益，确保劳动者在劳动关系中享有应有的权利和待遇。
特殊场景探讨：
- 在某些特殊情况下，如用人单位与劳动者之间存在模糊地带或争议焦点，法院可能需要更加细致地审查双方提供的证据，以准确判断劳动关系的存在与否。但无论如何，法院的判决都是基于事实和法律的，不会违反法律规定。
行动建议：
- 如果您作为劳动者或用人单位，在劳动争议案件中遇到类似问题，建议积极收集证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录等，以证明或反驳劳动关系的存在。
- 同时，也可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。在劳动争议案件中，专业律师的指导和帮助往往能够起到事半功倍的效果。
法律后果提示：
- 如果法院判决形成劳动关系，用人单位需要承担相应的法律责任，如支付劳动报酬、缴纳社会保险等。如果用人单位不履行判决，劳动者可以申请法院强制执行。
- 如果用人单位对判决不服，可以在法定期限内提起上诉或申请再审，但需要提供充分的证据和理由来支持自己的主张。