工资结构本身不影响仲裁申请加班费，但工资结构中的具体内容如加班费计算基数等，可能会对加班费的计算和仲裁结果产生影响。
详细分析：
工资结构与加班费的关系：
- 工资结构通常包括基本工资、津贴、奖金、加班费等组成部分。这些部分各自独立，但又相互关联。
- 加班费是劳动者在法定工作时间之外加班所应获得的额外报酬，其计算通常基于劳动者的基本工资或约定的加班费计算基数。
工资结构对加班费计算的影响：
- 如果工资结构中明确规定了加班费的计算基数，那么这个基数将直接影响加班费的数额。
- 如果工资结构中没有明确规定加班费的计算基数，通常会按照劳动者的基本工资或当地最低工资标准来计算。
工资结构在仲裁申请中的考虑：
- 在申请仲裁加班费时，劳动者需要明确加班费的计算基数和加班时长，以便仲裁机构能够准确计算加班费。
- 工资结构中的其他组成部分，如津贴、奖金等，通常不会直接作为加班费的计算依据，但可以作为劳动者整体收入的一部分，在仲裁过程中作为参考。
仲裁申请加班费的注意事项：
- 劳动者在申请仲裁加班费时，应提交充分的证据来证明加班事实的存在、加班时长以及加班费的计算依据。
- 劳动者还需要了解当地的劳动法规和仲裁程序，以确保自己的权益得到有效维护。
总结：
综上所述，工资结构本身并不直接影响仲裁申请加班费，但工资结构中的具体内容，特别是加班费的计算基数，会对加班费的计算和仲裁结果产生重要影响。因此，劳动者在申请仲裁加班费时，应仔细审查自己的工资结构，并准备充分的证据来支持自己的主张。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。