结论：工伤六级康复后工作了五年再辞职，公司是否有补偿需分情况讨论，主要取决于辞职的原因以及是否符合相关法律法规的规定。

分析：

1. 若因个人原因辞职：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工因个人原因提出辞职，通常不享有经济补偿。因此，在这种情况下，工伤六级康复后工作了五年再因个人原因辞职，公司一般无需支付补偿。

2. 若因公司原因辞职（如公司未提供劳动条件、未支付劳动报酬等）：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，员工因公司存在违法行为（如未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等）而提出辞职的，公司应当向员工支付经济补偿。
   • 经济补偿的计算标准通常按照员工在公司工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。因此，若工伤六级员工因公司原因辞职，且符合上述条件，公司应支付相应的经济补偿。

3. 若因工伤复发或职业病等原因辞职：

   • 如果工伤六级员工在康复后工作期间，工伤复发或确诊为职业病，且因此需要辞职治疗或休养，这种情况下，员工可能享有工伤保险待遇，包括医疗费用、伤残津贴等。但关于辞职本身的经济补偿，仍需根据辞职的具体原因和法律法规的规定来判断。
   • 特别地，如果工伤复发或职业病导致员工完全丧失劳动能力，且符合提前退休或退职条件的，员工可能享有相应的退休或退职待遇，而非辞职补偿。

建议：

• 对于工伤六级康复后工作了五年再辞职的员工，建议首先明确辞职的原因，并了解相关法律法规的规定，以便判断自己是否享有经济补偿的权利。
• 如果符合经济补偿的条件，建议与公司进行协商，要求公司按照法律法规的规定支付相应的经济补偿。
• 如果与公司协商无果，可以向当地劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。

注意事项：

• 在处理此类问题时，务必保留好相关证据，如劳动合同、工资单、工伤认定书、辞职申请书等，以便在需要时提供证明。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。