员工申请离职时，关于工资是否可以结清的问题，这主要取决于公司的具体规定、劳动合同的约定以及当地的劳动法律法规。不过，从普遍的法律原则和实际操作来看，我可以为您详细解答如下：
一、法律原则
根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，在法律层面，用人单位有义务在员工离职时结清其当月工资，无论离职是正常、被迫还是因用人单位违法解除劳动关系。
二、具体情况分析
正常离职：
- 如果员工按照公司规定流程（如试用期提前3天、正式员工提前30天）以书面形式通知用人单位解除劳动合同，那么用人单位在办理离职手续时，应一次性结清员工当月的工资。
被迫离职：
- 当用人单位存在过错，如未提供劳动保护、未及时支付工资、未缴纳社保等，导致劳动者被迫离职时，用人单位同样需在劳动者离职时结清当月工资及之前拖欠的工资。
违法解除劳动关系：
- 如果用人单位无正当理由或违反法律规定解除与劳动者的劳动关系，劳动者可以要求用人单位支付工资至离职之日，并可能获得赔偿金。
三、实际操作中的考虑因素
- 公司规定与劳动合同约定：不同公司可能有不同的财务流程和薪资发放制度。有些公司可能规定在员工离职后的一定时间内（如次月发薪日）支付剩余工资，而有些公司则可能在办理完离职手续后立即支付。因此，员工在离职前应仔细阅读劳动合同和公司规定，了解薪资发放的具体时间和方式。
- 社保扣除与个税缴纳：实际结算时，用人单位会考虑社保扣除和个税缴纳等因素，这可能导致结算稍有延迟。但无论如何，用人单位都应在离职后的合理时间内完成工资结算。
四、权益维护途径
- 协商：如果员工对工资结算有疑问或不满，首先应尝试与用人单位协商解决。
- 投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，寻求政府部门的帮助。
- 劳动仲裁：如问题仍未解决，员工可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结：
员工申请离职时，用人单位在法律上有义务结清其当月工资。但具体能否立即结清及结清时间可能因公司规定、劳动合同约定以及当地劳动法律法规而有所不同。因此，建议员工在离职前与公司进行充分沟通，了解薪资发放的具体时间和方式，并在离职过程中保留好所有与薪资相关的证据。如果遭遇工资结算问题，员工应了解自己的法律权益，并通过合法途径维护自身利益。