结论：违法直接发包的情况下，能否追究承包单位未建立农民工工资专用账户的责任，需视具体情况而定，主要取决于发包行为的违法性是否影响到了承包单位建立工资专用账户的义务履行，以及相关法律法规的具体规定。以下从不同角度进行分析：
一、违法发包与工资专用账户建立义务的关系
违法发包不影响承包单位基本义务：
- 即便发包行为存在违法性，如未通过合法招标程序或违反相关资质要求等，这并不直接免除承包单位建立农民工工资专用账户的义务。因为建立工资专用账户是保障农民工工资支付的重要制度，其设立旨在确保工资支付的透明度和可追溯性，与发包行为的合法性无直接关联。
违法发包可能间接影响工资专用账户的建立：
- 如果违法发包导致承包单位与发包单位之间的合同关系存在瑕疵或无效，可能会间接影响到承包单位履行建立工资专用账户的义务。例如，合同无效可能导致承包单位缺乏明确的合同依据来设立账户，或者发包单位拒绝配合提供必要的信息和协助。然而，这种情况下，承包单位仍应积极采取措施，如向相关部门报告或寻求法律援助，以履行其保障农民工工资支付的义务。
二、相关法律法规的规定
《保障农民工工资支付条例》：
- 根据该条例，施工总承包单位应当按照有关规定开设农民工工资专用账户，专项用于支付该工程建设项目农民工工资。这一规定明确了施工总承包单位（即承包单位）在工资支付方面的基本义务，未因发包行为的违法性而有所豁免。
违法发包的法律责任：
- 违法发包行为本身将受到相关法律法规的制裁，如罚款、责令改正、停业整顿等。然而，这些法律责任并不直接涉及承包单位未建立工资专用账户的问题。除非违法发包行为直接导致了承包单位无法履行其工资支付义务，且承包单位已尽到合理努力仍无法克服该障碍。
三、实际操作中的建议
承包单位应积极履行义务：
- 无论发包行为是否合法，承包单位都应积极履行建立农民工工资专用账户的义务，以确保农民工工资的按时足额支付。这是承包单位作为市场主体应尽的社会责任，也是遵守法律法规的基本要求。
发包单位应配合承包单位：
- 发包单位在发包过程中应遵守相关法律法规，确保发包行为的合法性。同时，在承包单位履行建立工资专用账户等义务时，发包单位应提供必要的协助和支持，如提供相关信息、配合办理手续等。
监管部门应加强监管：
- 监管部门应加强对发包和承包行为的监管力度，及时发现和纠正违法发包行为，确保农民工工资支付制度的得到有效执行。对于未建立工资专用账户等违法行为，监管部门应依法进行处罚，并督促相关单位及时整改。
总结来说，违法直接发包并不能直接成为追究承包单位未建立农民工工资专用账户责任的理由。承包单位应独立承担其建立工资专用账户的义务，不受发包行为违法性的影响。然而，在实际操作中，各方应共同努力，确保农民工工资支付制度的得到有效执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。