在钱已进入农民工工资专用账户但总包单位不同意发放的情况下，不能直接强制发放农民工工资，但可通过合法途径保障农民工工资权益。具体分析如下：

1. 专用账户性质与资金用途
   根据《保障农民工工资支付条例》第三十三条，农民工工资专用账户资金实行专款专用，仅用于支付农民工工资，不得因支付为本项目提供劳动的农民工工资之外的原因被查封、冻结或者划拨。这意味着，账户内资金已明确归属农民工工资范畴，总包单位无权擅自挪用或拒绝支付。

2. 总包单位不同意发放的合法性分析
   若总包单位拒绝发放工资的理由不成立（如无合法争议、未提供有效证据证明工资计算错误等），其行为可能违反《保障农民工工资支付条例》第三十条（分包单位未按月考核工作量、编制工资支付表并经农民工本人签字确认的，总包单位应先行清偿，再依法追偿）及第三十五条（总包单位未开设专用账户或未存储工资保证金，由人社部门责令限期改正，逾期不改正的责令项目停工，并处罚款）。此时，总包单位的拒绝行为缺乏法律依据。

3. 强制执行的合法途径

   • 行政途径：农民工可向当地人力资源社会保障行政部门（劳动监察大队）投诉，由行政部门责令总包单位限期支付工资；逾期不支付的，行政部门可向法院申请强制执行，或依法从工资保证金中划拨。
     
   • 司法途径：农民工可直接向法院提起民事诉讼，要求总包单位支付工资及赔偿金；若总包单位与分包单位存在连带责任（如未履行监督义务），可一并起诉。法院判决后，可申请强制执行专用账户内资金。
     
   • 刑事途径：若总包单位以转移财产、逃匿等方法逃避支付工资，数额较大且经政府责令支付仍不支付的，可能构成《刑法》第二百七十六条之一的拒不支付劳动报酬罪，农民工可向公安机关报案。

4. 实务建议

   • 证据固定：农民工应保留劳动合同、考勤记录、工资条、专用账户入账凭证等证据，以证明劳动关系及工资数额。
     
   • 联合维权：可推选代表向劳动监察部门或工会组织反映情况，提高维权效率。
     
   • 谨慎操作：避免直接划拨专用账户资金（除非通过法定程序），否则可能引发总包单位其他纠纷（如主张资金被错误划拨）。

总结：总包单位无权单方面拒绝发放专用账户内的农民工工资，但需通过行政投诉、民事诉讼或刑事报案等合法途径实现强制支付。农民工应优先通过劳动监察部门介入，若无效则及时启动司法程序。