结论：在工伤未查明且仍在医疗期的情况下，公司拒绝员工复工并要求签署自离终止确认劳动关系书的行为是违法的，员工有权拒绝签署，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。

法律背景与建议：

1. 工伤医疗期的权益：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，员工在工伤医疗期内享有停工留薪的待遇，即在此期间，员工无需工作，但工资福利待遇不变。这是为了保障员工在受伤后能够得到充分的休息和治疗，促进其尽快康复。
   • 在医疗期内，公司无权单方面解除与员工的劳动关系，也无权要求员工签署自离终止确认劳动关系书。

2. 公司的违法行为：

   • 公司拒绝员工复工并要求签署自离终止确认劳动关系书的行为，可能构成违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》的规定，公司违法解除劳动合同的，应当向员工支付赔偿金。
   • 此外，如果员工因工伤导致伤残，公司还可能面临承担工伤赔偿责任的风险，包括医疗费、伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等。

3. 员工的应对措施：

   • 拒绝签署：员工应坚决拒绝签署自离终止确认劳动关系书，并明确告知公司自己的工伤情况和医疗期内的权益。
   • 收集证据：员工应收集与工伤相关的证据，如医疗证明、工伤认定申请书、与公司的沟通记录等，以备后续维权之需。
   • 申请工伤认定：如果公司未及时为员工申请工伤认定，员工可以自行向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 寻求法律援助：员工可以咨询专业律师（如我），了解自己的权益和维权途径，并在必要时提起劳动仲裁或诉讼。

4. 可能的法律后果：

   • 如果公司坚持违法解除劳动合同，员工可以通过劳动仲裁或诉讼途径要求公司支付赔偿金、继续履行劳动合同或恢复劳动关系等。
   • 如果员工因工伤导致伤残，公司还需承担相应的工伤赔偿责任，包括支付医疗费、伤残补助金等。

进一步思考：

• 员工在工伤医疗期内应保持与公司的沟通，及时了解自己的工伤认定和赔偿进展情况。
• 如果公司存在违法行为，员工应果断采取法律措施维护自己的权益，避免错过维权时机。
• 在维权过程中，员工应保持冷静和理性，避免与公司的冲突升级，以免影响自己的权益和身心健康。

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