核心结论：工厂计件工资制下，员工一天上班12小时，在停工留薪期内的工资计算，不应简单去除多余的4小时，而应按照员工正常工作情况下的平均计件工资标准来计算停工留薪期工资，且该工资一般不低于当地最低工资标准的80%。以下从几个关键角度详细分析：

1. 停工留薪期工资的计算原则

根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”，对于实行计件工资制的员工，应当理解为员工在正常工作情况下，一定时期内的平均计件工资。因此，不能因为员工平时工作时间长，就简单地将超出标准工作时间的部分去除后计算停工留薪期工资。

2. 平均计件工资的确定方法

为了准确计算停工留薪期工资，需要确定员工在正常工作情况下的平均计件工资。这通常可以通过以下方式：

• 参考近期工资记录：查看员工在受伤前几个月的工资单，计算其平均每月的计件工资，然后除以月计薪天数（通常为21.75天），得到日平均计件工资。
• 考虑工作量和单价：如果员工的工作量相对稳定，且每件产品的单价明确，也可以根据员工平均每天完成的产品数量和单价来计算日平均计件工资。

3. 最低工资标准的保障

根据相关规定，停工留薪期内的工资待遇，即使按照平均计件工资计算后，也不得低于当地最低工资标准的80%。这是为了保障员工在停工留薪期间的基本生活需求。如果计算出的平均计件工资低于这一标准，用人单位应当按照最低工资标准的80%支付停工留薪期工资。

4. 特殊情况的处理

如果员工在受伤前的工作时间存在异常（如频繁加班、工作强度极大等），且这种异常情况并非员工个人原因导致，而是用人单位的工作安排，那么在计算平均计件工资时，应当考虑这种异常情况对工资水平的影响。但无论如何，都不能简单地将超出标准工作时间的部分去除后计算停工留薪期工资。

5. 实际操作建议

• 保留证据：员工应当保留好受伤前几个月的工资单、工作记录等证据，以便在需要时证明自己的平均计件工资水平。
• 与用人单位协商：在停工留薪期开始前或期间，员工可以与用人单位协商确定停工留薪期工资的具体数额和支付方式。
• 寻求法律援助：如果用人单位拒绝按照规定支付停工留薪期工资，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

总结：工厂计件工资制下，员工在停工留薪期内的工资计算，应基于其正常工作情况下的平均计件工资标准，且不得低于当地最低工资标准的80%。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。