关于员工退回回扣后追缴责任的承担问题，需分情况讨论，具体如下：
若员工因受贿而收取回扣，且已构成违法或犯罪：
- 法律责任：员工可能面临行政处罚（如罚款、没收违法所得）或刑事处罚（如受贿罪、非国家工作人员受贿罪等），具体取决于回扣的性质、数额及情节严重程度。
- 追缴责任：根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。因此，若员工因受贿被追究刑事责任，其已退回的回扣仍可能作为违法所得被追缴，但追缴的主体通常是司法机关（如法院），而非员工或用人单位直接承担。不过，从实际操作层面看，员工已主动退回回扣，可能在一定程度上减轻其法律责任，但不影响追缴程序的进行。
- 用人单位责任：若用人单位在员工受贿过程中存在过错（如明知或应知员工受贿而未制止），可能面临行政处罚（如罚款、吊销营业执照等），但一般不直接承担员工受贿所得的追缴责任。
若员工收取回扣不构成违法或犯罪，但违反用人单位规章制度：
- 法律责任：员工可能面临用人单位的内部处罚，如警告、罚款、解除劳动合同等。
- 追缴责任：若员工已主动退回回扣，且用人单位规章制度未明确规定需进一步追缴或赔偿，则员工一般无需承担额外责任。但若规章制度有明确规定（如“员工收取回扣需双倍赔偿”），则员工可能需按规章制度承担相应责任。不过，此类规章制度需符合法律法规的规定，否则可能因违法而无效。
- 用人单位责任：用人单位需确保规章制度的合法性，并依法对员工进行处罚。若规章制度违法或处罚过当，员工有权依法维权。
若员工收取回扣系因用人单位指示或默许：
- 法律责任：员工可能因执行用人单位指示而免除或减轻个人责任，但用人单位可能面临更严重的法律后果，如行政处罚、刑事责任（如单位受贿罪）等。
- 追缴责任：在此情况下，追缴责任通常由用人单位承担。员工已退回的回扣可能作为用人单位违法所得的一部分被追缴。
- 员工权益保护：员工有权拒绝执行用人单位的违法指示，并有权向相关部门举报用人单位的违法行为。若员工因执行违法指示而遭受损失，有权要求用人单位赔偿。
建议：
- 对于员工而言，若收取回扣，应立即主动退回，并如实向用人单位说明情况，避免构成违法或犯罪。同时，保留好退回回扣的证据（如转账记录、收条等），以备不时之需。
- 对于用人单位而言，应建立健全的规章制度，明确禁止员工收取回扣等违法行为，并加强对员工的培训和教育。若发现员工收取回扣，应及时处理，并依法追究相关责任。
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