若公司申诉撤销已认定的工伤，您可采取以下措施维护自身权益：

1. 明确公司申诉的合法性及程序要求
   根据《工伤保险条例》第五十五条，公司若对工伤认定结论不服，可在收到认定书之日起60日内向上一级社保部门申请行政复议，或6个月内向法院提起行政诉讼。需注意：公司申诉本身不直接否定工伤认定效力，仅启动法律审查程序，您无需因公司申诉而恐慌。

2. 收集并固定关键证据，强化工伤事实
   无论公司是否申诉，您均需保留以下证据：

   • 劳动关系证明：劳动合同、工资流水、考勤记录等；
     
   • 事故证据：现场照片、监控录像、同事证言、报警记录等；
     
   • 医疗证据：诊断证明、病历、医疗费票据、伤残鉴定报告等。
     若公司申诉时已提交反驳证据（如主张您非因工受伤），您需针对性补充证据，例如：若公司称您受伤系自残，您可提供无自残动机的证人证言或生活轨迹证明。

3. 积极配合社保部门或法院的调查程序

   • 若案件进入行政复议阶段，社保部门可能要求您补充材料或接受询问，务必按时配合；
     
   • 若公司提起行政诉讼，法院会通知您作为第三人参加诉讼，您需提交书面答辩意见并出庭陈述事实。
     关键点：您的参与程度直接影响案件结果，缺席可能导致社保部门或法院仅采信公司单方证据。

4. 区分“工伤认定撤销”与“工伤待遇支付”的独立性
   即使公司申诉成功撤销工伤认定，您仍可通过以下途径补救：

   • 重新申请工伤认定：若公司申诉理由不成立（如证据不足），您可要求社保部门重新作出认定；
     
   • 主张人身损害赔偿：若无法认定工伤，您可依据《民法典》第1179条，以公司未提供安全劳动条件为由，起诉公司承担侵权赔偿责任（需证明公司存在过错）。

5. 警惕公司“拖延战术”并主动推进程序
   部分公司可能通过申诉拖延赔偿时间，您可采取以下措施：

   • 向社保部门书面催告其限期作出复议决定；
     
   • 若公司提起诉讼，向法院申请先予执行部分医疗费用；
     
   • 同步申请劳动能力鉴定，提前确定伤残等级，为后续谈判或诉讼做准备。

最后提醒：工伤认定程序专业性较强，公司申诉期间您可能面临证据收集、法律文书撰写等困难。若您对程序不熟悉或证据不足，可直接向我咨询，我将结合您的具体案情，提供从证据整理到诉讼代理的全流程指导。