关于您提出的“工伤认定申请公司想撤回怎么办”的问题，这是一个涉及法律程序和权益保障的重要事项，需要谨慎处理。以下是我为您整理的详细解答：
一、撤回申请的基本原则
在工伤认定申请的过程中，如果公司（即用人单位）想要撤回申请，必须遵循一定的原则。具体来说，如果社保行政部门或劳动保障行政部门尚未对工伤认定申请作出决定，公司有权申请撤回。但一旦行政部门作出了决定，公司就无法直接撤回申请了。如果对认定结果有异议，需要通过行政复议或行政诉讼等法律途径来解决。
二、撤回申请的具体流程
提交书面申请：公司需要向受理工伤认定申请的社保行政部门或劳动保障行政部门提交书面的撤回申请。申请中应明确表达撤回的意愿，并详细说明撤回的原因。
等待审核与批准：社保行政部门或劳动保障行政部门会对撤回申请进行审核。如果工伤认定程序尚未进入实质性调查核实阶段，撤回申请较易获得批准。如果已经进入调查阶段，部门会综合考量后作出决定。
三、撤回申请的影响及再次申请规定
影响：撤回工伤认定申请可能会对公司的权益产生不利影响，比如放弃可能获得的工伤赔偿等法定权益。因此，在撤回前，公司务必充分考虑并咨询专业劳动法律师，以确保决策的明智性。
再次申请时限：如果公司希望再次申请工伤认定，需要注意时限问题。根据《工伤保险条例》的规定，用人单位的申请时限为事故发生之日起三十日内。如果错过了这个时限，可能会面临无法再次申请的风险。
四、对认定结果有异议的处理方式
如果公司对工伤认定结果有异议，不能直接撤回申请，但可以通过以下两种方式来处理：
行政复议：公司可以在收到工伤认定决定书之日起六十日内，向上一级社保行政部门或同级人民政府提出行政复议申请。复议机关会对工伤认定决定的合法性和合理性进行审查，并作出相应决定。
行政诉讼：如果公司不想通过行政复议来解决问题，也可以在收到工伤认定决定书之日起六个月内，直接向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。法院会对工伤认定决定进行司法审查，并根据审理结果作出判决。
五、结论与建议
综上所述，工伤认定申请的撤回是一个需要谨慎对待的法律问题。公司在考虑撤回申请前，应充分了解撤回的影响、再次申请的时限以及对认定结果有异议的处理方式。为了确保决策的合法性和明智性，我建议公司在撤回前咨询专业劳动法律师以获取更具体的法律建议和指导。同时，公司也应遵守相关法律法规的规定，维护自身合法权益的同时，也尊重他人的合法权益。