若个人土地被未经合法程序建设大型钢结构厂房，您有权通过法律途径要求停止侵害、恢复原状或索赔；若建设行为合法但影响您权益，可通过协商、行政投诉或民事诉讼主张权利。以下分情况详细说明：

一、建设行为未经合法程序（如未取得规划许可、未签订土地流转协议等）

1. 核心法律依据
   根据《土地管理法》第七十七条，未经批准非法占用土地建建筑物的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施。若涉及耕地，还可能触犯《刑法》第三百四十二条非法占用农用地罪。

2. 具体处理步骤

   • 第一步：固定证据
     立即对现场进行拍照、录像，记录厂房建设时间、规模、施工方信息，并留存土地权属证明（如土地承包合同、宅基地证等）。
     
   • 第二步：向行政部门投诉
     向当地自然资源局（原国土局）或综合执法局举报，要求查处非法占地行为。行政部门有权责令停工、限期拆除并恢复土地原状。
     
   • 第三步：提起民事诉讼
     若行政部门未及时处理，您可向法院起诉建设方，主张停止侵害、排除妨碍、赔偿损失（如土地收益损失、恢复费用等）。

3. 风险提示
   若厂房已建成且涉及多方利益（如政府招商项目），行政查处可能面临阻力，需做好长期维权准备。

二、建设行为合法（如已取得规划许可、土地流转协议等），但影响您权益

1. 常见权益受损情形

   • 厂房噪音、粉尘污染影响生活；
     
   • 厂房遮挡采光、通风；
     
   • 土地流转协议未约定补偿条款，导致收益受损。

2. 处理方式

   • 协商补偿
     与建设方协商，要求支付污染补偿、采光补偿或调整土地流转价格。
     
   • 行政投诉
     向环保部门投诉污染问题，或向规划部门申请复核厂房是否符合间距、高度等规划要求。
     
   • 民事诉讼
     若协商、投诉无果，可起诉建设方主张相邻权侵权（如《民法典》第二百八十八条至第二百九十六条），要求停止侵害、赔偿损失。

3. 关键证据
   需提供专业机构出具的污染检测报告、采光分析报告，或土地流转协议、权属证明等文件。

三、特殊情形：土地被征收后建设厂房

若您的土地已被政府依法征收，但您认为补偿不合理或程序违法：

1. 核查征收程序
   要求政府出示征收批文、补偿安置方案、评估报告等文件，确认是否符合《土地管理法》第四十七条规定的“先补偿后征收”原则。
   
2. 申请行政复议或诉讼
   若征收程序违法，可在知道征收决定之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼，主张撤销征收决定或要求重新补偿。

建议：无论哪种情形，均需优先通过行政途径解决（效率较高），若行政途径受阻，再启动法律程序。处理过程中注意保留所有沟通记录、文件证据，避免与建设方发生直接冲突。如有疑问，可直接向我咨询具体操作细节。