当您发现自己的土地被他人侵占并用于盖厂房时，这确实是一个需要严肃对待的问题，因为它直接侵犯了您的土地使用权。为了有效维护您的权益，我建议您按照以下步骤来处理：

一、明确土地权属并收集充分证据

首先，您需要确认自己对该土地拥有合法的使用权或所有权。这是维权的基础，也是后续所有行动的前提。为了证明这一点，您需要准备相关的土地权属证明，比如土地承包经营权证、宅基地使用证或者土地出让合同等官方文件。同时，您还需要收集对方侵占土地的证据，这可以通过拍照、录像等方式详细记录对方占用土地盖厂房的现状，包括厂房的具体位置、规模以及与您土地边界的清晰关系。如果可能的话，还可以收集邻居或其他目击者的证言，以进一步证实对方的侵权行为。

二、尝试与占地方进行友好沟通与协商

在掌握了充分的证据后，您可以尝试与占地方进行友好沟通。在沟通过程中，您需要明确指出对方的行为已经侵犯了您的土地权益，并要求对方停止施工、拆除违法建筑，并退还被占用的土地。为了确保沟通的有效性，建议您保持冷静和理性，避免情绪化的言辞，并做好录音，以备后续需要。

三、寻求基层组织的帮助进行调解

如果协商无果，您可以请求当地的村民委员会、居民委员会或人民调解委员会等基层组织介入调解。这些组织对当地情况比较熟悉，能够更有效地促进双方和解。在调解过程中，您需要清晰阐述自己的诉求和提供的证据，积极配合调解人员的工作，并尊重调解结果。

四、向相关部门进行投诉举报

如果调解仍然无法解决问题，您可以向相关部门进行投诉举报。具体来说，您可以向土地管理部门（如国土资源管理部门）反映情况，并提交相关证据。他们有权对非法占地行为进行查处，包括责令占地方停止违法行为、限期拆除违法建筑等。另外，如果该建房行为还违反了城乡规划规定，您还可以向城乡规划部门投诉，他们会依法对违法建设行为进行处理。

五、考虑提起诉讼来维护自己的权益

如果上述途径均未能解决问题，您可以考虑向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。在诉讼中，您可以要求对方停止侵权、排除妨碍、恢复土地原状，并赔偿因侵权行为给您造成的全部损失。为了确保诉讼的成功，您需要按照法院的要求提供充分的证据，并积极参与庭审等各项诉讼程序。

六、注意事项

在整个处理过程中，我建议您保持冷静和理性，避免采取过激行为导致自己陷入不必要的法律纠纷。同时，您还需要时刻关注法律法规的变化，确保自己的维权行动始终符合法律要求。

综上所述，面对土地被侵占并盖厂房的情况，您需要明确土地权属、收集证据、尝试沟通协商、寻求基层组织调解、向相关部门投诉举报，并在必要时提起诉讼来维护自己的合法权益。希望这些建议能够对您有所帮助。