核心结论：在厂房建设被举报到国土部门后，您需要积极配合调查，根据不同情况采取相应措施，包括补办手续、整改或接受处罚等。以下是具体分析和建议：
核实举报内容与事实情况
- 首先，您需要核实举报内容是否属实，即厂房建设是否存在未取得合法用地手续、超出批准范围建设或违反土地利用总体规划等违法行为。
- 如果举报内容不实，您可以准备相关证据材料（如土地使用证、规划许可证、施工许可证等）向国土部门说明情况，澄清事实。
配合国土部门调查
- 无论举报内容是否属实，您都应积极配合国土部门的调查工作，提供必要的文件、资料和说明。
- 调查过程中，保持沟通畅通，及时回应国土部门的询问和要求。
根据调查结果采取相应措施
- 如果厂房建设合法：国土部门确认后，举报事项将得到妥善处理，您无需承担法律责任。
- 如果存在轻微违法行为：如未及时办理用地手续但符合土地利用总体规划，国土部门可能会责令您限期补办手续，并可能处以罚款。此时，您应尽快按照要求补办手续，并缴纳罚款（如有）。
- 如果存在严重违法行为：如未经批准擅自占用土地、超出批准范围建设或违反土地利用总体规划等，国土部门可能会责令您退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并可能处以较重的罚款。此时，您应认真考虑国土部门的处罚决定，并在规定期限内履行义务。如果对处罚决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
寻求专业法律帮助
- 在处理此类事务时，涉及法律条款众多、程序复杂，建议您寻求专业律师的帮助。律师可以协助您分析案情、准备证据材料、与国土部门沟通协商，并在必要时代表您参与行政复议或行政诉讼程序。
预防未来风险
- 为了避免未来再次发生类似问题，建议您在厂房建设前充分了解并遵守相关法律法规和政策要求，确保用地手续合法、规划许可齐全、施工符合规范。
- 定期对厂房建设情况进行自查自纠，及时发现并纠正可能存在的问题。