关于超合同约定的加班计算问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要事项。首先，我们要明确的是，加班工资的计算主要依据的是双方签订的劳务合同以及《中华人民共和国劳动法》的相关规定。
一、合同约定优先原则
在劳务合同中，如果双方已经明确约定了加班工资的计算方式，比如每小时加班费用是正常工作小时报酬的一定倍数（如1.5倍、2倍等），或者直接约定了一个固定的加班费用金额，那么我们就应当首先遵循这个约定来执行。
二、无约定或约定不明时的处理
如果劳务合同中没有对加班及加班费作出明确约定，或者约定不明确，那么我们就需要参照《劳动法》的相关规定来确定加班费用。具体来说：
标准工时制下的加班计算：
综合计算工时制下的加班计算：
不定时工时制下的加班计算：
三、月工资基数的确定
在计算加班工资时，月工资基数的确定也是一个关键问题。根据相关规定，月工资基数应根据劳动合同约定确定；若劳动合同无约定，则依据集体合同；若劳动合同和集体合同均无约定，则按照劳动者本人正常劳动应得的工资确定。
四、法律保障与维权途径
如果劳动者在超时加班方面的权益受到侵害，比如用人单位恶意拖欠或不合理压低加班费用，劳动者有权向人民法院提起民事诉讼，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，超合同约定的加班计算方式应首先遵循合同约定，同时也可参照《劳动法》的相关规定。在双方无明确约定或约定不明的情况下，应通过协商、参考行业标准或诉诸法律途径来确保劳动者的合法权益得到妥善保障。希望这些信息能对您有所帮助，如果您还有其他疑问或需要进一步的法律建议，请随时咨询。