孕妇在工作期间违反公司规章制度，若构成严重违反，公司是有权开除的，但必须确保规章制度的合法性、合理性以及辞退程序的正当性。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与特殊保护
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。这一规定适用于所有劳动者，包括处于孕期、产期、哺乳期的女职工。
特殊保护：
- 尽管孕妇享有特殊的劳动保护，如《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条规定的，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依据该法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。但这并不意味着孕妇可以无视公司制度，当其行为构成严重违规时，用人单位仍有权依法解除劳动合同。
二、对“严重违反公司制度”的界定
“严重违反公司制度”通常需基于公司具体且合法的规章制度来判断。这些制度必须经过民主程序制定、内容合法并已向劳动者公示。常见的严重违规情形包括但不限于：
- 考勤问题：如长期旷工、无故缺勤，且未履行请假手续或提供正当理由。
- 工作纪律：在工作期间从事与工作无关的活动，经多次警告仍不改正，严重影响工作效率和秩序。
- 保密与职业道德：泄露公司机密、收受贿赂、利用职务之便谋取私利等行为，给公司造成损失或风险。
三、辞退程序的合法性要求
在辞退怀孕女职工时，用人单位必须遵循严格的法律程序：
- 充分调查：对女职工的违规行为进行全面、客观的调查，并收集确凿证据。
- 通知工会：按照《中华人民共和国劳动合同法》第四十三条的规定，事先将辞退理由通知工会，并听取其意见。
- 书面送达：以书面形式正式向女职工送达辞退决定，明确说明辞退的原因和法律依据。
四、法律后果与争议解决
法律后果：
- 若用人单位违法辞退孕妇，孕妇有权要求继续履行劳动合同或要求支付赔偿金。赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍，具体计算方式依据劳动者在本单位工作的年限来确定。
争议解决：
- 双方对辞退事宜存在争议时，可通过劳动仲裁等法律途径进行解决。仲裁机构或法院将依据相关法律法规和事实情况作出公正裁决。
五、综合建议
对于用人单位：
- 在处理孕妇违反公司制度的问题时，应谨慎对待，确保决策的合理性和合法性。首先，要审查公司规章制度的合法性和有效性；其次，要客观评估孕妇的违纪行为是否构成“严重违反”；最后，在辞退过程中要严格遵循法定程序和要求。
对于孕妇：
- 应自觉遵守公司制度，维护良好的劳动关系。若认为公司的辞退决定不当，可以依法主张继续履行合同，并要求用人单位赔偿因劳动合同解除日至恢复日之间的工资损失。
总结来说，孕妇在工作期间若严重违反公司合法有效的规章制度，公司是有权解除劳动合同的，但必须确保规章制度的合法性、合理性以及辞退程序的正当性。在任何情况下，都应尊重和保护劳动者的合法权益，特别是孕妇这一特殊群体的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。