怀孕期间违反考勤制度，用人单位并非绝对不能开除，但需满足严格条件并遵循法定程序。以下是对此问题的详细分析：
一、法律对孕期女职工的特殊保护
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依据该法第四十条（无过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这一规定体现了法律对孕期女职工的特殊保护，旨在保障女职工及胎儿的权益。
二、用人单位可解除劳动合同的情形
尽管孕期女职工享有特殊保护，但并非拥有“绝对保护符”。依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，若女职工存在严重违反用人单位规章制度等情形，用人单位可以依法解除劳动合同。具体到考勤制度，若孕妇的行为构成严重违规，如多次旷工、严重迟到早退等，且用人单位的规章制度合法有效并已向劳动者公示，则用人单位有权解除劳动合同。
关键条件：
- 规章制度合法有效：用人单位的规章制度必须通过民主程序制定，并向劳动者公示，确保劳动者知晓并同意遵守。
- 严重违反规章制度：孕妇的违纪行为必须达到规章制度所规定的“严重”程度，如多次旷工、严重失职给公司造成重大损失等。
- 程序合法：用人单位在解除劳动合同时，应提前通知工会，并在解除劳动合同时向劳动者说明理由，确保整个过程的透明度和合法性。
三、法律后果与争议解决
- 法律后果：若用人单位违法辞退孕妇，孕妇有权要求继续履行劳动合同或要求支付赔偿金。赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍，具体计算方式依据劳动者在本单位工作的年限来确定。例如，若孕妇在本单位工作满一年，则用人单位需支付两个月的工资作为赔偿金。
- 争议解决：双方对辞退事宜存在争议时，可通过劳动仲裁等法律途径进行解决。仲裁机构或法院将依据相关法律法规和事实情况作出公正裁决。
四、综合分析与建议
- 用人单位角度：在处理孕妇违反考勤制度的问题时，用人单位应谨慎对待，确保决策的合理性和合法性。首先，要审查公司规章制度的合法性和有效性；其次，要客观评估孕妇的违纪行为是否构成“严重违反”；最后，在辞退过程中要严格遵循法定程序和要求。
- 孕妇角度：孕妇应自觉遵守公司制度，维护良好的劳动关系。若因特殊情况（如身体不适）无法按时出勤，应及时与用人单位沟通并说明情况，争取理解和支持。
总结：怀孕期间违反考勤制度，用人单位并非绝对不能开除，但必须满足严格条件并遵循法定程序。在任何情况下，都应尊重和保护劳动者的合法权益，特别是孕妇这一特殊群体的权益。若您在此方面遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。