孕妇严重违反公司规章制度，公司一般不能直接合法解除劳动合同，但在特定情况下可以解除。以下从不同角度为你详细分析：

法律对孕妇的特殊保护

根据《劳动合同法》以及相关法律法规，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依照《劳动合同法》第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这是法律对孕妇这一特殊群体的保护，旨在保障她们在特殊时期的就业权益和生活稳定。例如，公司不能因为孕妇不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位仍不能胜任工作为由解除劳动合同；也不能因为公司经营状况发生严重困难，需要裁员等理由解除与孕妇的劳动合同。

孕妇严重违反规章制度时公司的处理

虽然孕妇受到特殊保护，但如果孕妇严重违反公司的规章制度，公司并非完全不能解除劳动合同。不过，公司需要满足以下条件：

1. 规章制度合法有效：公司的规章制度必须是通过民主程序制定，不违反国家法律、行政法规及政策规定，并且已经向劳动者公示。如果规章制度本身不合法或者未公示，那么公司依据该规章制度解除劳动合同就是违法的。比如，公司制定的规章制度中规定“孕妇迟到一次即解除劳动合同”，这样的规定可能因过于严苛且不合理而被认定为无效。
2. 有充分证据证明孕妇严重违反规章制度：公司需要提供确凿的证据，如监控录像、书面记录、证人证言等，证明孕妇确实存在严重违反规章制度的行为。例如，孕妇多次旷工，公司有考勤记录、请假记录等证据证明其旷工事实，且旷工天数达到了公司规章制度中规定的“严重违反”的标准。
3. 解除程序合法：公司在解除劳动合同前，应当事先将理由通知工会。如果公司没有成立工会，应当向当地劳动行政部门报告。只有在履行了这些法定程序后，公司才能解除与孕妇的劳动合同。

违法解除劳动合同的法律后果

如果公司违反法律规定解除与孕妇的劳动合同，孕妇可以要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付赔偿金。赔偿金的计算标准为：按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付一个月工资的赔偿金。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

建议：对于公司而言，在处理孕妇违反规章制度的问题时，一定要谨慎行事，确保规章制度合法、证据充分、程序合法，避免因违法解除劳动合同而承担法律责任。对于孕妇来说，如果认为自己被公司违法解除劳动合同，要及时收集相关证据，通过劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。如果你有进一步的疑问或者需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。