结论：协商辞职时，未休完的年假工资发放倍数需根据具体情况判断，一般可按日工资收入的300%支付，但已享受当月工资且未安排补休的，可能只支付200%。具体分析如下：

一、年假工资发放的一般规定

根据《企业职工带薪年休假实施办法》第十条，用人单位经职工同意不安排年休假或者安排职工年休假天数少于应休年休假天数，应当在本年度内对职工应休未休年休假天数，按照其日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬，其中包含用人单位支付职工正常工作期间的工资收入。这意味着，在正常情况下，如果员工未休完年假，用人单位应按照日工资收入的300%支付工资。这里的日工资收入，是按照员工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算的。

二、协商辞职时的特殊情况

然而，在协商辞职的情况下，情况可能有所不同。如果员工与用人单位协商一致解除劳动合同，并且双方就年假的补偿问题达成了协议，那么应按照协议来执行。如果协议中未明确年假的补偿方式，那么可以参照上述的一般规定来处理。但有一种特殊情况需要注意，即如果员工在辞职前已经享受了当月的工资，且用人单位未安排其补休年假，那么用人单位可能只需按照员工日工资收入的200%支付未休年假的工资报酬（因为已经支付了正常工作期间的工资收入，所以只需额外支付200%的报酬）。不过，这一做法并非绝对，具体还需根据双方协商的结果和当地的法律法规来确定。

三、实际操作建议

1. 查看劳动合同和公司规章制度：首先，员工应查看自己的劳动合同和公司的规章制度，了解其中关于年假和辞职补偿的规定。
2. 与用人单位协商：如果劳动合同或规章制度中未明确规定，员工应与用人单位进行协商，就年假的补偿问题达成一致意见。
3. 保留相关证据：在协商过程中，员工应保留好相关证据，如聊天记录、邮件往来等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
4. 寻求法律援助：如果协商无果，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权益和可行的维权途径。

四、示例说明

假设某员工的月工资为5000元，其日工资收入为5000元除以21.75天，约为229.89元。如果该员工在协商辞职时还有5天年假未休，且双方未就年假补偿问题达成协议，那么按照一般规定，用人单位应支付该员工未休年假的工资报酬为：229.89元/天 × 5天 × 300% = 3448.35元（其中已包含正常工作期间的工资收入）。但如果双方协商一致，用人单位只支付200%的报酬，那么应为：229.89元/天 × 5天 × 200% = 2298.9元（扣除已支付的正常工作期间工资收入后的额外补偿）。

有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，给出更详细的法律建议。