结论前置：卫生不合格能否扣工资，取决于公司是否有明确且合法的规章制度作为依据，以及扣钱行为是否符合相关法律法规。一般情况下，单位以卫生不合格为由直接扣工资是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、合法扣工资的情形
法定扣除情形：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》，用人单位不得无故克扣劳动者工资。工资是劳动者提供劳动服务后应得的报酬，其支付受到法律的严格保护。除非符合法定的扣除情形，如代扣代缴个人所得税、社会保险费用、法院判决的抚养费或赡养费等，否则任何单位或个人均不得擅自扣减。卫生不合格显然不属于这些法定扣除情形之一。
规章制度合法且合理：
- 若用人单位试图通过内部规章制度来规定因卫生不合格扣款，该规章制度必须满足严格的法律要求方能有效。具体来说，规章制度的内容必须合法合理，不能违反法律法规的强制性规定，且处罚措施要符合公平原则；制定过程需经过民主程序，如职工代表大会讨论，并与工会或职工代表平等协商确定；最后，规章制度还需向全体劳动者公示，确保其知晓并理解相关规定。如果单位的规章制度未能满足上述条件，那么以此为依据扣减工资同样是违法的。
二、非法扣工资的情形及后果
缺乏明确制度依据：
- 若公司无相关卫生管理制度或制度规定模糊不清，则扣钱行为缺乏合法性基础。劳动者有权拒绝此类不合理的扣款，并可以通过法律途径维护自己的权益。
制度制定程序违法：
- 若规章制度未经民主程序制定或未向员工公示，则该制度对员工不具有约束力，扣钱行为不合理且不合法。劳动者可以向劳动行政部门举报或申请劳动仲裁，要求公司返还被扣的工资。
扣钱影响员工基本权益：
- 扣罚后员工工资不得低于当地最低工资标准，且不得严重影响员工的基本生活。若扣钱行为导致员工工资低于最低工资标准或严重影响其基本生活，则扣钱行为不合理且可能违法。劳动者有权要求公司补足工资差额，并可能获得额外的经济补偿。
三、员工维权途径
沟通协商：
- 员工首先可与公司进行沟通协商，要求公司说明扣钱依据和理由。若公司无法提供合法合理的依据，员工有权拒绝扣款。
举报与仲裁：
- 若协商不成，员工可向劳动行政部门举报公司的违法行为，或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。劳动行政部门或仲裁机构将依法对公司的行为进行审查，并作出公正的裁决。
法律诉讼：
- 对仲裁结果不满意时，员工可在拿到仲裁书后15天内向法院起诉。法院将依法审理案件，并作出最终的判决。
四、建议与提醒
- 对于公司：应制定合法合理的规章制度，并确保制度的制定过程符合民主程序和公示要求。在处罚员工时，应确保处罚措施合法、合理且公正，避免侵犯员工的合法权益。
- 对于员工：应了解自己的权利和义务，积极维护自己的合法权益。在面对不合理的扣款行为时，应勇敢站出来说“不”，并通过合法途径维护自己的权益。
综上所述，卫生不合格能否扣工资并非一个简单的问题，它取决于公司是否有明确且合法的规章制度作为依据，以及扣钱行为是否符合相关法律法规。若您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。