针对您提出的“员工搞卫生不合格公司是否有权罚款”的问题，这确实是一个涉及员工权益与公司管理权限的复杂议题。以下是我为您提供的详细分析：
一、公司罚款的合法性基础
首先，我们需要明确的是，根据我国相关法律，罚款作为一种行政处罚权，是专属于行政机关的。公司，作为非行政机关，并不具备法律直接赋予的罚款权力。因此，从严格的法律意义上讲，公司自行设定并执行罚款制度，在缺乏合法依据的情况下，是对员工权益的侵犯。
二、公司罚款可能合法的情况
尽管公司罚款在大多数情况下是不合法的，但在特定条件下，罚款行为可能被视为合法。这主要取决于以下两点：
规章制度明确且合理：如果公司在依法制定的规章制度中，明确规定了卫生不达标的具体情形、罚款措施以及罚款金额，并且该规章制度经过了职工代表大会或全体职工的讨论，与工会或职工代表平等协商确定，同时进行了公示或告知劳动者，那么公司依据此规章制度进行的罚款，在罚款金额合理且不影响劳动者基本生活的前提下，可能被认定有效。
员工行为导致公司实际损失：若员工因卫生不合格给公司造成了实际经济损失，如客户投诉导致业务受损、被相关部门处罚等，公司可以根据相关法律法规要求员工赔偿损失。但赔偿需遵循一定程序，如先进行损失评估，经劳动者确认后从工资中扣除，且每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
三、公司合法处理员工卫生问题的建议
对于员工卫生不合格的问题，公司应采取更为合法、合理且有效的处理方式，如：
批评教育：对员工进行口头或书面的批评教育，指出其卫生问题，并要求其立即改正。
扣发奖金或福利：如果公司有相关的绩效考核或奖金制度，可以依据劳动合同中的约定，扣发员工因卫生不合格而应得的奖金或其他福利。
解除劳动合同：在员工卫生问题严重到违反公司规章制度或劳动合同约定，且经过多次批评教育仍不改正的情况下，公司可以依据劳动合同法的相关规定解除劳动合同。
四、员工权益保护
作为员工，如果面对公司的不合法罚款，您有权采取以下措施维护自己的合法权益：
与公司沟通协商：首先，您可以与公司进行沟通协商，要求其说明罚款的依据和合理性。
向劳动监察部门投诉：如果公司无法提供合法依据或您认为罚款不合理，您可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求政府部门的帮助。
申请劳动仲裁：如果投诉无果，您可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径解决争议。
提起诉讼：如对仲裁结果不满，您还可以在规定时间内向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
综上所述，公司因员工卫生不合格而进行罚款的合理性取决于多个因素的综合考量。公司应确保自身行为的合法性和合规性，同时尊重和保护员工的合法权益。员工也应了解自己的权益，并在面对不合法罚款时积极采取措施维护自身权益。