结论：员工因刑事拘留未返岗，公司以此为由解除劳动合同，员工是否可以申请赔偿金，需根据具体情况判断。以下分情况详细说明：

1. 若员工被刑事拘留但未被法院判决有罪

   • 法律背景：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同需有合法依据。员工被刑事拘留，并不直接等同于被认定有罪，此时员工仍处于法律上的“无罪推定”状态。
   • 法律建议：若公司仅因员工被刑事拘留而解除劳动合同，且未提供其他合法解除理由（如员工严重违反公司规章制度等），则可能构成违法解除劳动合同。员工有权要求公司支付赔偿金。
   • 赔偿金计算：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。若公司违法解除劳动合同，员工有权要求双倍的经济补偿，即赔偿金。

2. 若员工被刑事拘留且最终被法院判决有罪

   • 法律背景：若员工因犯罪被法院判决有罪，且该犯罪行为与员工的工作职责或公司利益有直接关联，或者员工因犯罪行为被依法追究刑事责任，公司有权根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，解除与员工的劳动合同，且无需支付经济补偿。
   • 法律建议：在此情况下，员工因自身犯罪行为导致劳动合同解除，通常无法要求公司支付赔偿金。但若员工认为公司解除劳动合同的行为存在违法或不当之处（如公司未按照法定程序解除劳动合同），仍可寻求法律途径维护自身权益。
   • 特殊情况：若员工被刑事拘留后，公司未等待法院判决即直接解除劳动合同，且后续员工被法院判决无罪，则公司可能构成违法解除劳动合同，员工有权要求公司支付赔偿金。

进一步思考：

• 证据收集：员工在申请赔偿金时，应收集相关证据，如公司解除劳动合同的通知、员工被刑事拘留的证明、法院判决文书等，以证明公司的解除行为是否合法。
• 协商与调解：在申请赔偿金前，员工可尝试与公司进行协商或调解，以达成和解协议，避免不必要的法律纠纷。
• 法律途径：若协商或调解无果，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，以维护自身合法权益。

总结：员工因刑事拘留未返岗，公司以此为由解除劳动合同，员工是否可以申请赔偿金，需根据员工是否被法院判决有罪以及公司解除劳动合同的合法性来判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。