铁路单位员工旷工5天，工资通常按以下方式计算，但具体处理需结合单位规章制度及劳动合同约定：

1. 基本工资扣除
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若铁路单位规章制度明确规定旷工扣薪标准（如按日工资倍数扣除），且该制度已通过民主程序制定并公示，则单位可按制度执行。例如：日工资为300元，旷工5天可能扣除1500元（若制度规定每日扣3倍日工资），但扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 全勤奖与绩效工资影响
   若劳动合同或单位制度中约定了全勤奖、绩效工资等与出勤挂钩的福利，旷工5天可能导致全勤奖全额扣除，绩效工资按比例扣减（如旷工1天扣20%绩效，5天可能扣完当月绩效）。

3. 单位合法解除劳动合同的风险
   根据《劳动合同法》第三十九条，严重违反用人单位规章制度的，单位可解除劳动合同且无需支付经济补偿。若铁路单位规章制度明确规定“旷工5天属于严重违纪”，且该制度已履行民主程序并告知劳动者，则单位有权单方解除合同。此时工资计算至离职日，但单位可能无需支付赔偿。

建议行动：

• 立即查阅劳动合同及单位《员工手册》，确认旷工扣薪、违纪解除的具体条款；
  
• 若单位扣薪比例过高（如扣除后工资低于最低标准）或未公示制度，可向劳动监察部门投诉；
  
• 若面临解除合同，可要求单位出具书面解除通知，并核实解除依据是否合法。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。