结论：公司注销时若资金不足无法补偿员工，员工可通过法律途径维护自身权益，具体方式需根据公司注销的具体情况和员工权益受损程度来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、公司注销与员工补偿的基本法律关系
公司注销，意味着公司法人资格的消灭，其民事权利能力和民事行为能力随之终止。在公司注销前，公司应当依法进行清算，清偿包括员工工资、经济补偿金等在内的各项债务。若公司注销时资金不足，无法全额支付员工补偿，这并不意味着员工权益的丧失，员工仍有权通过法律途径寻求救济。
二、员工可采取的法律措施
参与清算程序：
- 在公司注销前的清算过程中，员工应积极参与，了解公司的资产状况、债务情况等，确保自己的权益得到充分保障。
- 若清算组未依法通知员工申报债权，员工有权向清算组提出异议，并要求清算组重新通知或采取其他补救措施。
申请劳动仲裁：
- 若公司注销前未依法支付员工补偿，员工可在公司注销后一定期限内（通常为一年）向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付拖欠的工资、经济补偿金等。
- 仲裁过程中，员工需提供相关证据，如劳动合同、工资单、解除或终止劳动合同的证明等，以证明自己的权益受损。
提起民事诉讼：
- 若劳动仲裁裁决未支持员工的诉求，或员工对仲裁裁决不服，员工可在收到仲裁裁决书后一定期限内（通常为十五日）向人民法院提起诉讼。
- 诉讼过程中，员工需继续提供证据支持自己的主张，并可能面临举证责任、诉讼时效等法律问题。
追究股东或清算组成员责任：
- 若公司注销过程中存在股东或清算组成员未依法履行清算义务，导致员工权益受损的情况，员工有权要求股东或清算组成员承担赔偿责任。
- 这通常涉及对公司注销过程中是否存在违法行为的调查和取证，以及后续的法律诉讼程序。
三、特殊情况下的处理
公司破产清算：
- 若公司因资不抵债而进入破产清算程序，员工的工资和经济补偿金将作为破产债权参与分配。
- 在这种情况下，员工需按照破产法的规定申报债权，并等待破产管理人的分配方案。若分配方案未满足员工的诉求，员工仍有权提出异议或提起诉讼。
公司恶意注销：
- 若公司存在恶意注销、逃避债务等行为，员工有权向相关部门举报，并要求追究公司及相关责任人的法律责任。
- 这可能涉及对公司注销程序的合法性进行审查，以及后续的法律追责程序。
四、建议与提醒
- 及时行动：员工在发现公司注销且资金不足无法补偿时，应尽快采取法律措施，以免错过诉讼时效或仲裁时效。
- 保留证据：员工应妥善保管与劳动关系、工资支付、经济补偿等相关的证据材料，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。
- 寻求专业帮助：由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，员工在采取法律措施前可咨询专业律师（如我），以获取更具体的法律建议和指导。
有问题直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律解答和帮助。