甲方在合同中约定向施工单位收取安全风险抵押金，这一行为主要违反了《中华人民共和国民法典》中关于合同自由原则及禁止非法收取费用的相关规定。具体分析如下：

1. 合同自由原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在订立合同时应当遵循自愿、公平、等价有偿、诚实信用的原则。合同内容应由双方协商确定，任何一方不得将自己的意志强加给另一方。
   • 甲方在合同中单方面约定收取安全风险抵押金，可能构成对施工单位意志的强制，违反了合同自由原则。特别是当这种收取没有合法依据或超出合理范围时，更可能被视为不公平的合同条款。

2. 禁止非法收取费用：

   • 在法律没有明确规定或双方没有特别约定的情况下，任何一方不得擅自向对方收取额外费用。安全风险抵押金并非法律规定的必须收取的费用，也非行业惯例中的普遍做法。
   • 如果甲方无法提供合法依据来支持其收取安全风险抵押金的合理性，那么这种行为可能被视为非法收取费用，违反了相关法律法规。

法律建议：

• 对于施工单位而言，如果认为甲方收取的安全风险抵押金不合理或违法，可以与甲方进行协商，要求修改或删除相关条款。
• 如果协商无果，施工单位可以向相关行业主管部门投诉，或者通过法律途径（如提起诉讼或申请仲裁）来维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果法院或仲裁机构认定甲方收取安全风险抵押金的行为违法，那么甲方可能需要退还已收取的抵押金，并可能面临一定的法律责任（如赔偿损失、支付违约金等）。

在实际操作中，合同双方应当严格遵守法律法规，确保合同内容的合法性和合理性。如果有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。您有任何具体的法律问题，都可以直接向我咨询。