国企干部醉驾不起诉，两年后单位也可能会根据内部规定进行处理。具体分析如下：
一. 醉驾的法律后果
- 不起诉不代表无罪：醉驾属于危险驾驶罪，根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条之一，醉酒驾驶机动车的，处拘役，并处罚金。虽然检察院可能基于某些原因决定不起诉，但这并不意味着醉驾行为没有发生或不被视为违法行为。
- 犯罪记录与影响：即使不起诉，醉驾的记录仍可能保留在相关部门的档案中，对个人未来的职业发展、社会评价等产生负面影响。
二. 国企单位的内部处理
- 国企的纪律要求：国企作为公有制企业，通常对员工的道德品质、遵纪守法等方面有较高要求。醉驾行为违反了社会公德和法律法规，与国企的纪律要求相悖。
- 内部处理的可能性：国企单位在得知员工醉驾后，即使检察院不起诉，也可能根据内部规章制度对员工进行相应处理。这种处理可能包括警告、记过、降职、辞退等，具体取决于单位的规定和醉驾行为的严重程度。
- 处理时机的灵活性：国企单位对员工的处理并不受检察院起诉与否的限制，也不受时间限制。因此，即使醉驾行为发生在两年前且未被起诉，单位在得知后仍有权根据内部规定进行处理。
三. 我的观点
- 醉驾是严重的违法行为，不仅危及自身和他人的生命安全，还可能对个人职业生涯造成不可挽回的损失。
- 国企单位作为社会的一份子，有责任维护良好的社会形象和纪律秩序。因此，对于员工的醉驾行为，单位有权且有可能根据内部规定进行处理。
综上所述，国企干部醉驾不起诉后，单位在两年后仍可能根据内部规定进行处理。我建议您了解并遵守单位的规章制度，同时珍惜自己的职业生涯和声誉，避免类似违法行为的再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。