针对您提出的“醉驾不起诉单位如何处理”的问题，这确实是一个涉及法律程序和行政处罚的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，醉驾不起诉并不意味着被不起诉人完全免除了所有责任。在醉驾案件中，即使检察机关作出了不起诉决定，被不起诉人仍可能面临行政处罚。这是因为刑事处罚与行政处罚在目的和承担责任的形式上存在差异，两者并不互相排斥。
一、行政处罚的可能性
吊销驾驶证：根据《道路交通安全法》的相关规定，醉驾者通常会被吊销机动车驾驶证，且在一定期限内（如5年、10年或终生）不得重新取得。这是醉驾者必须承担的行政处罚之一。
罚款或行政拘留：除了吊销驾驶证外，如果检察机关认为被不起诉人需要给予行政处罚，会提出检察意见，并移送有关主管机关（如公安机关）处理。公安机关可能会根据《道路交通安全法》的相关规定，对被不起诉人处以罚款或行政拘留。
二、单位处理的方式
内部纪律处分：如果醉驾者是某单位的员工，单位在得知其醉驾行为后，可能会根据内部规章制度对其进行纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。这种处分是基于单位对员工行为的管理和约束，与法律处罚并行不悖。
配合法律程序：单位在处理醉驾员工时，应积极配合法律程序，如提供必要的证据材料、协助调查等。同时，单位也可以向检察机关或公安机关表达对醉驾行为的看法和处理建议。
三、加强行刑衔接的建议
为了解决被不起诉人“免刑逃罚”的问题，可以从以下几个方面加强行刑衔接工作：
统一执法认识：明确刑事处罚与行政处罚的区别和联系，避免对同一事实进行二次评价，同时确保被不起诉人受到应有的行政处罚。
校准处罚标准：根据醉驾的违法性和危害性，制定合理的处罚标准，确保醉驾者受到的处罚重于酒驾者。
推进处罚前移：在醉驾案件移送审查起诉前，如果已达酒驾标准，可要求公安机关先行作出相应行政处罚决定，并将行政处罚材料随案移送。
建立制度规范：完善“两法衔接”工作机制，增强制度规范性、科学性和可操作性。通过定期清查、制定操作指引等方式，确保不起诉案件得到妥善处理。
综上所述，醉驾不起诉并不意味着被不起诉人完全免除了所有责任。单位在处理醉驾员工时，应积极配合法律程序，并根据内部规章制度进行纪律处分。同时，为了加强行刑衔接工作，需要统一执法认识、校准处罚标准、推进处罚前移并建立制度规范。希望这些解答能对您有所帮助。