结论：公司故意设置弹性上班制度导致员工每日工作不足8小时，员工是否算加班需根据具体情况判断，主要取决于员工实际工作时间是否超出法定或约定工作时间，以及公司是否支付了相应的加班费。

分析说明：

1. 法定工作时间与加班定义：

   • 根据《劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。若员工因公司弹性上班制度导致实际工作时间超过此标准，则超出部分应视为加班。
   • 加班是指劳动者在正常工作时间之外，继续从事本职工作或由用人单位安排的其他工作。加班时间通常包括工作日加班、休息日加班和法定节假日加班。

2. 弹性上班制度下的加班判断：

   • 若弹性上班制度导致员工实际工作时间不足8小时，但公司未安排额外工作或任务：在此情况下，员工并未超出法定工作时间，因此不构成加班。员工应享受正常的工资待遇，无需额外支付加班费。
   • 若弹性上班制度下，员工实际工作时间超过8小时，或公司安排了额外工作或任务：此时，超出部分应视为加班。公司应按照法律规定支付加班费，加班费的标准通常根据加班时间的长短和工资基数来确定。

3. 加班费的计算与支付：

   • 工作日加班：按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班费。
   • 休息日加班：若不能安排补休，则按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班费。
   • 法定节假日加班：按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。

法律建议：

• 员工方面：若员工认为公司弹性上班制度导致自己加班，应首先与公司沟通协商，要求公司支付相应的加班费。若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 公司方面：公司应合理设置弹性上班制度，确保员工的工作时间符合法律规定。若因工作需要安排员工加班，应依法支付加班费，避免引发劳动纠纷。

可能后果：

• 若公司未依法支付加班费，员工有权要求公司支付拖欠的加班费及相应的经济补偿。
• 若公司因弹性上班制度导致员工权益受损，可能面临劳动监察部门的处罚或员工的法律诉讼，影响公司的声誉和正常运营。

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