从新入职工资中扣除之前未扣的借支款项，这一做法的合理性取决于具体的合同约定以及公司的规章制度。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同约定与规章制度的重要性

1. 合同约定：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当签订书面劳动合同，并在合同中明确双方的权利和义务。如果借支及扣款事项在劳动合同中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照合同约定从新入职工资中扣除之前未扣的借支款项是合理的。

2. 公司规章制度：即便劳动合同中没有明确约定，但如果公司的规章制度中对此有明确规定，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，对劳动者具有约束力。在这种情况下，用人单位依据规章制度从新入职工资中扣除借支也是合理的。

二. 扣款操作的合法性

• 用人单位在扣款时，应确保扣款行为不违反法律法规的强制性规定，如不得低于最低工资标准支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠劳动者工资等。

三. 实际操作中的注意事项

1. 明确告知：用人单位在扣款前，应明确告知劳动者扣款的原因、金额及依据，确保劳动者的知情权。

2. 及时结算：借支及扣款事项应及时结算清楚，避免长时间拖延导致纠纷。

我的观点：从新入职工资中扣除之前未扣的借支款项，在合同有明确约定或公司规章制度有明确规定，且扣款行为合法、合理的情况下，是合理的。但用人单位应确保扣款操作的合法性，并充分保障劳动者的知情权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。