你因身体不舒服想辞职但老板不让，这是不合法的，你依法享有辞职的权利。针对这种情况，你可以按照以下步骤来处理：

一、明确法律依据与权利

根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者享有提前解除劳动合同的权利。具体来说，你只需提前三十日以书面形式通知用人单位，就可以解除劳动合同；若处于试用期内，则提前三日通知即可。这是你的法定辞职权，无需用人单位批准。

二、提交书面辞职申请并保留证据

1. 提交辞职申请：建议你以书面形式向用人单位提交辞职申请，明确表达离职意愿及离职日期。这样做不仅符合法律规定，也是保护自身权益的重要步骤。
2. 保留关键证据：在提交辞职申请时，务必保留好辞职信的副本以及送达的相关凭证，如快递回执单、电子邮件记录等。同时，收集并整理好医院出具的诊断证明、病历等，以证明你确实因身体原因无法继续工作。

三、与用人单位沟通协商

在正式离职前，你可以尝试与用人单位进行坦诚沟通，解释你的身体状况和离职原因，争取用人单位的理解和支持。通过协商，你们可以寻求双方都能接受的解决方案，如过渡性的工作安排或协助交接工作等，以减少因离职给公司带来的不便。

四、依法办理离职手续

如果与用人单位沟通无果，你仍可在通知期届满后依法办理离职手续：

1. 办理工作交接：按照公司规定的流程，与同事、上级进行工作交接，确保交接过程有记录且双方签字确认。
2. 要求出具离职证明：用人单位有义务在解除或终止劳动合同时出具相应的证明，并在规定时间内为你办理档案和社会保险关系转移手续。你有权要求用人单位出具离职证明，若其拒绝，你可以向当地劳动行政部门投诉。

五、寻求外部帮助与维护权益

如果用人单位无理拒绝你的离职申请，或者因此产生劳动争议，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 向劳动监察部门投诉：你可以携带相关证据到当地的劳动监察大队投诉，劳动监察部门会依法对用人单位进行监督检查，并责令其改正违法行为。
2. 申请劳动仲裁：若劳动监察部门处理后问题仍未解决，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在仲裁过程中，你需要提供相关证据来支持自己的诉求，如病假证明、劳动合同、辞职信及送达凭证等。

在整个过程中，保留好相关证据是至关重要的，它将为你的权益提供有力保障。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。