当员工因身体原因无法继续工作，但又不愿主动离职，同时面临用人单位可能的不理解或拒绝辞职申请的情况时，员工可以采取以下详细且具有深度的步骤来维护自己的合法权益：
一、明确并行使法律赋予的辞职权利
首先，员工需要清楚了解《中华人民共和国劳动合同法》中关于辞职的相关规定。根据法律，员工有权提前解除劳动合同，具体为：提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期员工则只需提前三日）。这是员工辞职的坚实法律基础，无论身体状况如何，员工都享有这一权利。
二、与用人单位进行深入且坦诚的沟通
详细说明身体状况：
- 员工应准备详细的医疗证明，如医院诊断书、病历、医生建议等，以客观、具体的方式向用人单位说明自己的身体状况。
- 强调病情对工作能力的影响，以及继续工作可能带来的健康风险。
表达辞职的无奈与诚意：
- 明确表达自己并非主动想要离职，而是由于身体原因无法继续胜任工作。
- 展示对工作的尊重和珍惜，以及离职后的遗憾和无奈。
提出过渡与交接方案：
- 为了减轻用人单位的负担，员工可以主动提出协助完成工作交接、培训接替人员等过渡方案。
- 展示自己的责任感和团队精神，尽量减少离职对团队的影响。
三、正式且规范地提交书面辞职申请
- 员工应按照法律规定的时间节点，提前三十日（试用期提前三日）以书面形式向用人单位提交辞职申请。
- 辞职申请中应明确表达离职意愿、离职日期以及离职原因（身体原因）。
- 通过可靠方式保留送达证据，如邮政快递单据、电子邮件发送记录等，以备后续可能出现的争议。
四、考虑申请病假作为调整期
- 如果员工的病情确实需要休息和治疗，且暂时无法确定离职后的具体安排，可以向公司申请请病假。
- 在规定的医疗期内，用人单位不得解除劳动合同，这为员工提供了一个休养和调整的时间窗口。
- 员工应利用这段时间积极治疗、恢复健康，并同时考虑离职后的职业规划和生活安排。
五、寻求第三方调解或法律援助
申请劳动调解：
- 若与用人单位的沟通无果，员工可以向当地的劳动争议调解委员会申请调解。
- 调解委员会具有专业性和权威性，能够协助双方达成公平合理的解决方案。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若调解不成，员工可以根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
- 在申请仲裁或提起诉讼时，员工应准备好充分的证据来支持自己的诉求，如医疗证明、辞职申请、沟通记录等。
六、注意事项与心态调整
- 员工在提出离职申请时，务必提供真实有效的医疗证明和诊断报告，以证明自己的健康状况确实无法继续工作。
- 保持冷静和理性，避免与用人单位发生不必要的冲突和争执。
- 积极寻求家人、朋友或专业人士的支持和帮助，以更好地应对这一挑战。
综上所述，员工因身体原因无法继续工作而面临离职困境时，应依法行使自己的权利，通过深入沟通、规范提交辞职申请、申请病假或寻求法律援助等方式来解决问题。同时，保持积极的心态和合理的期望，相信问题最终会得到妥善解决。