超市员工盗窃超市东西，超市不可以直接不发工资，但可以根据具体情况扣除相应工资或通过合法程序解除劳动合同并不支付经济补偿。以下是对此问题的详细分析：
一、工资支付与扣除的法律规定
工资支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是用人单位的基本义务，不因员工的行为而轻易免除。
工资扣除的合法情形：
- 如果员工因盗窃行为给超市造成了经济损失，超市可以根据劳动合同的约定或依法制定的规章制度，要求员工赔偿经济损失。这种赔偿可以从员工的工资中扣除，但扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
二、员工盗窃行为的处理原则
严重违反规章制度：
- 超市通常会在其规章制度中明确规定禁止员工盗窃等行为。员工偷窃行为明显违反了这一规定，损害了超市的财产利益，违背了职业操守和诚信原则。只要超市的规章制度是依法制定的（内容合法、经过民主程序制定并向员工公示），超市即可依此对员工进行纪律处分，包括解除劳动合同。
解除劳动合同的合法程序：
- 如果超市决定因员工盗窃行为而解除劳动合同，必须遵循合法程序。这包括事先通知员工、听取其申辩、制作解除劳动合同决定书等。同时，超市应确保有充分确凿的证据证明员工的偷窃行为，以避免日后劳动纠纷。
经济补偿的免除：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同且无需支付经济补偿。因此，如果超市因员工盗窃行为而解除劳动合同，且程序合法、证据确凿，则无需向员工支付经济补偿。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：
- 超市在处理员工盗窃问题时，应确保有充分确凿的证据证明员工的偷窃行为。证据可包括监控录像、目击证人证言、被盗物品记录等。这是避免日后劳动纠纷的关键。
区分情节与处理方式：
- 对于初犯且偷窃情节轻微的员工，超市可考虑给予警告、罚款或调岗等较轻的处理措施。而对于偷窃价值高、情节严重或屡教不改的员工，则可依法直接解除劳动合同。
保护员工合法权益：
- 在处理员工盗窃问题时，超市应确保遵循合法程序，充分保护员工的合法权益。避免侵犯员工的名誉权、隐私权等。
四、法律后果与风险提示
法律后果：
- 如果超市未经合法程序或证据不足而擅自扣除员工工资或解除劳动合同，可能面临劳动仲裁或诉讼的风险。届时，超市可能需要支付违法解除劳动合同的赔偿金或补发工资等。
风险提示：
- 超市在处理员工盗窃问题时，应谨慎行事，确保程序合法、证据确凿。如有需要，可咨询专业律师以获取法律建议和支持。
总结来看，超市员工盗窃超市东西，超市不可以直接不发工资。但超市可以根据具体情况扣除相应工资（需遵守工资扣除的合法情形）或通过合法程序解除劳动合同并不支付经济补偿。在处理此类问题时，超市应确保遵循合法程序、充分保护员工合法权益，并承担严格的举证责任。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。