公司有权不接受该员工回来上班，但需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
从劳动合同解除的角度
根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若员工通过微信提出离职但未履行书面通知义务，且未完成工作交接或离职手续，从形式上看，劳动关系可能尚未合法解除。但若公司已实际接受其离职行为（如停止发放工资、注销工作权限等），可能被认定为双方协商一致解除劳动关系。此时员工要求返岗，公司有权拒绝。
从公司规章制度的角度
若公司《员工手册》或规章制度中明确规定“员工离职需办理书面手续，未完成手续者视为自动离职且不得返岗”，且该制度已通过民主程序制定并公示，则公司可依据制度拒绝员工返岗。但需注意，制度内容需合法合理，不得违反《劳动合同法》等强制性规定。
从实际履行情况的角度
若员工离职后，公司已招聘新人接替其岗位，或原岗位已撤销，导致客观上无法安排其返岗，公司可主张“客观情况发生重大变化”而拒绝返岗请求。但需提供证据证明岗位调整的合理性（如招聘记录、岗位撤销通知等）。
从员工主张权利的角度
若员工能证明其微信离职并非真实意思表示（如被胁迫、重大误解），或公司未履行法定解除程序（如未出具解除证明、未办理社保转移），员工可能通过劳动仲裁主张继续履行劳动合同。此时公司需承担举证责任，证明离职行为合法有效。
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