针对您提出的“员工微信提出离职但不愿意办理离职手续”的问题，我们可以从法律和实际操作两个层面来详细分析。
首先，从法律层面来看，员工通过微信提出离职，是否构成有效的书面解除劳动合同呢？根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条的规定，劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。而这里的“书面形式”，根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条的规定，不仅限于传统的纸质书面文件，以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，也视为书面形式。微信信息作为通过即时通信应用服务保存的通信信息，同样属于电子数据的一种，因此也构成书面形式。
在实际操作中，如果员工通过微信明确表达了离职的意愿，并且这一意愿被公司接收且双方对微信内容的真实性没有异议，那么可以认为员工已经以书面形式提出了离职申请。公司在此基础上安排离职手续，是符合法律规定的。
接下来，针对员工不愿意办理离职手续的情况，公司可以采取以下措施：
沟通解释：首先，公司可以与员工进行进一步的沟通，解释微信离职的法律效力，以及公司按照法律规定和内部流程安排离职手续的合理性。
书面确认：如果员工仍然坚持不愿意办理离职手续，公司可以要求员工出具书面的撤销离职申请或者确认继续履行的声明。如果员工拒绝出具，公司可以保留微信聊天记录等证据，以证明员工已经提出了离职申请。
法律途径：如果员工既不愿意办理离职手续，也不愿意出具书面声明，公司可以依据相关法律法规和内部规章制度，通过法律途径解决争议，包括但不限于向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
综上所述，员工通过微信提出离职，在法律上是被视为书面解除劳动合同的。如果员工不愿意办理离职手续，公司可以通过沟通解释、要求书面确认以及法律途径等方式来维护自身的合法权益。希望这些分析能对您有所帮助。