离职协议只签一份并不合法，离职协议应当一式两份，双方各执一份。以下从法律角度进行详细分析：
法律要求
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，劳动合同（包括离职协议）的签订应当遵循平等自愿、协商一致的原则，并且应当以书面形式订立。书面形式意味着合同或协议应当有双方当事人的签字或盖章，并且通常要求一式两份或更多份，以确保双方都能持有并保存一份原件。这是为了保障双方当事人的权益，避免在协议履行过程中因原件丢失或损坏而引发的纠纷。
法律效力
协议的有效性：离职协议作为双方就离职相关事宜达成的共识，其有效性依赖于双方的真实意思表示和合法合规的签订程序。如果只签一份，且该份协议未被双方共同确认或保存，那么在后续可能出现的争议中，该协议的证明力可能会受到质疑。
证据的保存：在劳动争议中，书面证据往往具有决定性的作用。如果离职协议只有一份，且该份协议由一方单独保管，那么在另一方需要证明协议内容时，可能会面临举证困难的问题。这不利于维护双方当事人的合法权益。
实际操作建议
签订一式两份：为了保障双方当事人的权益，建议在签订离职协议时，明确要求一式两份，双方各执一份。这样，在协议履行过程中，如果出现问题或争议，双方都可以依据自己持有的协议原件进行维权。
确保协议内容合法合规：除了签订形式外，离职协议的内容也应当合法合规。双方应当就离职时间、工资结算、经济补偿、保密义务等关键条款进行明确约定，并确保这些条款不违反法律法规的强制性规定。
保留好协议原件：签订离职协议后，双方应当妥善保管好自己持有的协议原件。在协议履行过程中，如果出现问题或争议，及时依据协议原件进行维权。
如果离职协议只签了一份，建议尽快与对方协商补签一份，以确保双方都能持有并保存一份原件。如果在补签过程中遇到问题或争议，可以寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。您有任何具体的法律问题，都可以直接向我咨询。