结论前置：员工请假不扣工资而直接抵年假的合法性需结合具体情况判断，并非绝对合法或非法。关键在于是否遵循了相关法律法规和用人单位的规章制度，并考虑了职工本人的意愿。
合法情况分析
员工同意与自主处分：
- 如果员工明确同意用请假的时间来抵扣年假，且这种抵扣不违反法律法规和用人单位的规章制度，那么这种做法是合法的。因为年假虽为法定权利，但员工有权自主处分其休假权利，同意抵扣即视为对自身权利的合法处分。
用人单位规章制度：
- 若用人单位有明确的规章制度，规定在特定情况下（如员工请假且不扣工资时）可以抵扣年假，且该规章制度在制定时经过了民主程序讨论，并向员工公示，那么这种规定可能被认定为有效。在此情况下，依据规章制度进行的抵扣也是合法的。
法律法规的允许：
- 根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位应统筹安排职工年休假，考虑职工本人意愿。这意味着，在尊重员工意愿的前提下，单位有权安排年休假，包括可能的抵扣安排（如请假不扣工资时抵年假）。但前提是这种安排必须合法合规，且不得侵犯员工的合法权益。
非法情况分析
未经员工同意：
- 用人单位未经员工同意，擅自将请假时间抵扣年假，这侵犯了员工自主安排年假的权利，是不合法的。年假是员工的法定假期，员工有权在合适的时间按照自己的意愿申请和安排休假。
规章制度不合法或未公示：
- 如果用人单位的规章制度在制定时没有经过民主程序讨论，或未向员工公示，那么即使其中有关于请假不扣工资时抵年假的规定，该规定也是无效的。以这样的规定来抵扣年假，同样是不合法的。
违反法律法规的强制性规定：
- 如果抵扣年假的做法违反了法律法规的强制性规定（如未支付员工应得的工资报酬），那么这种做法也是不合法的。
法律建议与注意事项
查看用人单位规章制度：
- 员工应仔细查看用人单位的规章制度，了解关于年休假和其他假期的具体规定。如果规章制度中有关于请假不扣工资时抵年假的条款，员工应判断该条款是否合法合规，并考虑自己的意愿和利益。
与用人单位沟通：
- 在遇到请假不扣工资而抵年假的情况时，员工应与用人单位进行沟通，明确双方的权利和义务。如果员工不同意抵扣年假，应向用人单位说明理由，并要求用人单位尊重自己的意愿。
保留相关证据：
- 如认为用人单位的做法不合法，员工应保留相关证据（如工资条、考勤记录、请假申请、规章制度等），以便在必要时维护自己的合法权益。
寻求法律援助：
- 如果员工与用人单位在年假抵扣问题上无法达成一致，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的法律权益和维权途径。
作为张俊华律师，我建议员工在遇到此类问题时，要仔细了解自己的法律权益和用人单位的规章制度，与用人单位进行充分沟通，并在必要时寻求法律援助。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。