结论前置：单位请假抵扣年休假是否合法，需结合具体情况判断。在符合法律法规且经员工同意的前提下，特定情形下的抵扣可能是合法的；但若无正当理由或违反相关规定，则构成违法。
合法情况分析
员工同意与自主处分：
- 如果单位提前与员工进行了充分的沟通协商，并且员工明确同意用请假时间来抵扣年假，这种情况下是合法的。因为年假虽为法定权利，但员工有权自主处分其休假权利，同意抵扣即视为对自身权利的合法处分。
规章制度的有效性：
- 若单位有明确的规章制度，规定在特定情况下请假可以抵扣年假，且该规章制度在制定时经过了民主程序讨论，并向员工公示，那么这种规定可能被认定为有效。在此情况下，依据规章制度进行的抵扣也是合法的。
特定假期抵扣：
- 根据《职工带薪年休假条例》及相关规定，若员工因病假、事假等超出一定天数，且单位有明确规定这些假期可以抵扣年假，同时员工也知晓并同意这一规定，那么这种抵扣也是合法的。例如，员工累计工作满1年不满10年的，请病假累计2个月以上且单位按照规定不扣工资的，可能不享受当年的年休假，此时若单位规定病假天数可抵扣年假，且员工同意，则合法。
法律依据：
- 根据《职工带薪年休假条例》第五条，单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。这意味着，在尊重员工意愿的前提下，单位有权安排年休假，包括可能的抵扣安排。同时，单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300％支付年休假工资报酬。
不合法情况分析
未经员工同意：
- 单位未经员工同意，擅自将请假时间抵扣年假，这侵犯了员工自主安排年假的权利，是不合法的。年假是员工的法定假期，员工有权在合适的时间按照自己的意愿申请和安排休假。
规章制度不合法：
- 如果单位的规章制度在制定时没有经过民主程序讨论，或未向员工公示，那么即使其中有关于请假抵扣年假的规定，该规定也是无效的。以这样的规定来抵扣年假，同样是不合法的。
法定节假日不可抵扣：
- 法定节假日是全体员工统一放假的日子，这些天数不能用于抵扣员工的年假。如果单位试图将法定节假日计入抵扣范围，也是违法的。
员工权益保护与救济途径
- 如果员工认为单位请假抵扣年假的行为侵犯了自己的合法权益，首先应与单位进行沟通协商，要求单位纠正错误做法。
- 若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉，要求维护自己的合法权益。
- 员工还可以选择申请劳动争议仲裁，通过法律途径来维护自己的年假权益。
总结与建议：单位请假抵扣年休假是否合法，需综合考虑多种因素，包括员工的意愿、规章制度的合法性以及法律法规的具体规定。在任何情况下，都应尊重员工的合法权益，确保年假制度的正确实施。如果员工对单位的做法有疑问或不满，建议及时咨询专业律师或相关劳动部门，以维护自己的合法权益。