病假抵扣年休假在一般情况下是不合法的，但具体是否合法需结合公司规章制度、劳动合同约定及当地法律法规综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与原则
年休假的性质：
- 根据《职工带薪年休假条例》，年休假是劳动者依法享有的带薪休假权利，旨在保障劳动者的休息权益，提高生活质量和工作效率。
病假的性质：
- 病假是劳动者因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，用人单位应给予的医疗期，期间工资照发或按一定比例发放。
法律原则：
- 年休假和病假是两种不同性质的假期，分别对应不同的法律情形和待遇。用人单位不得擅自将年休假抵扣病假，否则可能侵犯劳动者的合法权益。
二、特殊情况下的合法性探讨
公司规章制度与劳动合同：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了可以用年休假抵扣病假，且该规定不违反法律法规的强制性规定，同时经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），并向劳动者进行了公示告知，那么在一定程度上可以视为双方当事人的约定。然而，这种约定必须合理、合法，并经过劳动者同意。
法律风险：
- 若用人单位未经劳动者同意，单方面决定用年休假抵扣病假，可能构成对劳动者权益的侵害。劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位纠正违法行为并赔偿损失。
三、实际操作中的建议
了解自己的权益：
- 劳动者应了解自己的法定权益，包括年休假和病假的具体规定。根据《职工带薪年休假条例》第四条，只有在特定条件下（如累计工作满1年不满10年的职工，请病假累计2个月以上等），职工才不享受当年的年休假。但这并不意味着病假可以直接抵扣年休假。
审查公司规章制度和劳动合同：
- 在遇到用人单位要求用年休假抵扣病假的情况时，劳动者应仔细审查公司规章制度和劳动合同的相关条款。如果发现规定不合理或违法，应及时提出异议。
沟通协商与法律途径：
- 劳动者应与用人单位进行沟通协商，要求其按照法律规定分别计算病假和年假。如果协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位改正；也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付未休年假的工资报酬等。
保留证据：
- 劳动者在维权过程中应保留好相关的病假证明、年假记录以及用人单位的规章制度等证据，以便在需要时维护自己的合法权益。
总结：病假抵扣年休假的问题涉及劳动者的休息休假权利，是一个重要的法律问题。在一般情况下，病假和年假不能相互抵扣。但在特殊情况下，如果用人单位的规章制度有明确规定且符合法律法规的要求，同时经过了民主程序制定并向劳动者进行了公示告知，可能存在病假抵扣年假的合法性。然而，这种抵扣必须合理、合法，并经过劳动者同意。劳动者在遇到此类问题时，应积极采取措施维护自己的合法权益，并通过法律途径寻求帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。