当学校食堂在开学后被发现食品证过期或者存在过期食品时，相关部门会依据《食品安全法》及相关法规进行严肃处理。以下是针对这一问题的详细处罚措施和分析：
一、主要处罚依据及措施
行政处罚
- 没收违法所得与罚款：根据《食品安全法》第一百二十四条，如果学校食堂违法生产经营的食品货值金额不足一万元，将面临五万元以上十万元以下的罚款；货值金额一万元以上的，则处货值金额十倍以上二十倍以下的罚款。
- 吊销许可证：对于情节严重的违规行为，如过期食品导致集体性食物中毒事件，相关部门有权责令停产停业，直至吊销许可证。
刑事责任追究（如适用）
- 如果因过期食品造成了严重后果，如人员重伤或死亡，相关责任人可能会被追究刑事责任。例如，生产销售不符合安全标准食品罪最高可处三年以上七年以下有期徒刑。
民事赔偿责任
- 受害者有权要求赔偿因食用过期食品而产生的医疗费、误工费等损失。如果家长发现孩子食用后身体不适，可以通过法律途径进行索赔。
二、具体执行流程
调查取证阶段
- 市场监管部门在接到举报后，会立即封存过期食品，并追溯其来源，检查采购记录、库存台账等证据链，以确保处罚的公正性和准确性。
整改与听证程序
- 学校需立即下架问题食品，并提交整改方案。对于拟作出的重大处罚，如吊销许可证，行政机关会组织听证会，以保障当事人的陈述权。
信息公开与社会监督
- 处罚结果通常会通过政府网站进行公示，以形成社会震慑效应。例如，某幼儿园因使用过期食用油被罚款并吊销许可证的案例公开后，周边机构纷纷加强自查。
三、实际案例参考
- 案例一：某幼儿园食堂使用过期食用油，被处以10万元罚款并吊销许可证，园长被追责。
- 案例二：某小学因未及时清理过期牛奶，被家长举报后，除行政罚款外还需向受影响学生家庭支付赔偿金。
- 红安县案例：红安县某小学食堂因未落实“三防”措施、留样食品未标注日期、冰柜温度计失效、过期食品未规范存放及处理等问题，被罚款6000元，并责令立即改正违法行为，对过期食品进行无害化处理并记录。
四、建议与应对措施
- 学校方面：应严格遵守食品安全法规，定期检查食品有效期，及时下架过期食品，并加强员工培训，提高食品安全意识。
- 家长方面：如果发现学校食堂存在过期食品等问题，应保留证据（如拍摄过期食品照片、视频，保存购物小票或食堂就餐凭证），及时向当地市场监管部门（电话12315）或教育部门反映情况，并配合调查。
综上所述，学校食堂开学后食品证过期或存在过期食品将面临严重的行政处罚、刑事责任追究以及民事赔偿责任。因此，学校应高度重视食品安全问题，确保学生的饮食安全。