结论前置：用人单位让员工自行计算工时是否合法需分情况讨论，计算方式需符合法律规定。以下是具体分析：

1. 用人单位让员工自行计算工时的合法性

• 合法情形：若用人单位已制定合法、明确的工时计算制度（如标准工时制、综合计算工时制或不定时工作制），并已向员工公示或通过劳动合同约定，仅要求员工按制度记录工时（如打卡、填写工时表），则属于合法管理行为。
  法律依据：《劳动合同法》第4条，用人单位应依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。
• 违法情形：若用人单位未制定合法工时制度，或要求员工自行计算工时后克扣工资、超时加班未支付加班费，或通过“自算工时”逃避法定工时限制（如每月加班超过36小时），则涉嫌违法。
  法律依据：《劳动法》第41条（加班限制）、第44条（加班费标准）。

2. 工时如何合法计算

• 标准工时制（每日≤8小时，每周≤40小时）：
  
  1. 正常工作时间按实际出勤计算；
     
  2. 加班时间需单独记录，并支付150%（工作日）、200%（休息日）、300%（法定节假日）的工资。
     示例：员工周一至周五每天工作9小时，其中1小时为加班，应按150%支付加班费。
• 综合计算工时制（需经劳动行政部门审批）：
  以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但平均日/周工作时间不得超过法定标准。超出部分视为加班，支付150%工资（休息日加班不另计）。
  示例：某岗位经审批实行季度综合工时制，季度总工时超过500小时（法定504小时）的部分，按150%支付加班费。
• 不定时工作制（需审批）：
  无固定工作时间限制，但用人单位需保障员工休息权，且法定节假日工作需支付300%工资。
  注意：部分地区规定不定时工作制员工无加班费（除法定节假日），需结合地方规定。

3. 员工注意事项

• 保留工时记录证据（如打卡记录、工时表、邮件等）；
  
• 核对工资条中的工时及加班费计算是否正确；
  
• 若用人单位未支付加班费或超时用工，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：用人单位可要求员工记录工时，但需确保制度合法、计算透明、加班费足额支付。若存在争议，建议结合具体证据（如劳动合同、工时记录、工资条）进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。