工厂以有绩效为由不支付加班费是不合理的，且通常不符合法律规定。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

法律层面

根据相关法律规定，加班费是劳动者因用人单位生产和工作需求，在规定工作时间之外继续劳动或工作而获得的报酬。绩效工资作为工资的一部分，若员工在正常工作时间之外加班，且加班期间的工作成果包含绩效部分，那么这部分绩效工资应当被纳入加班费的计算中。例如，员工为了获取更多业绩（此业绩涉及绩效工资）而进行加班工作，在计算加班费时就应当把绩效工资因素考虑进去。

企业举证责任

如果企业能够证明绩效工资与加班工作没有关联，比如绩效只是基于正常工作时间内的表现，那么企业可以单独计算绩效工资和加班费。但这种情况下，企业需要承担起举证的责任，提供充分的证据来证明绩效工资与加班工作无关。若企业无法提供有效证据，则不能随意将绩效工资从加班费计算中剔除。

实际操作建议

1. 保留证据：劳动者在加班时，应保留好相关证据，如加班通知、工作记录、绩效成果等，以便在发生纠纷时能够证明自己的加班情况和绩效成果。
2. 与企业协商：若发现企业以有绩效为由不支付加班费，劳动者可以先与企业进行协商，要求企业按照法律规定支付加班费。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：若协商无果，劳动者可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或直接向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

可能的法律后果

如果企业违反法律规定，以有绩效为由不支付加班费，可能会面临以下法律后果：

1. 补发加班费：企业需要补发劳动者应得的加班费。
2. 支付经济补偿：根据相关法律规定，企业还可能需要向劳动者支付经济补偿。
3. 行政处罚：劳动行政部门有权对企业进行行政处罚，如罚款等。

总结与建议：工厂以有绩效为由不支付加班费是不合理的，且通常不符合法律规定。劳动者在遇到此类情况时，应保留好相关证据，与企业进行协商，若协商无果，则可以申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。