借调到新单位工作后再辞职是合法的，但具体合法性及后续处理需视情况而定。以下是从不同角度的详细分析：

1. 劳动合同关系

• 原单位合同：借调期间，您与原单位的劳动合同关系通常仍然存续。这意味着，如果您想辞职，原则上应按照与原单位的劳动合同及相关规定来办理辞职手续。
• 新单位角色：在新单位工作，可能是基于与原单位及新单位的借调协议。但这一协议并不改变您与原单位的劳动合同关系，因此辞职时仍需与原单位协商。

2. 辞职的合法性

• 一般规定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者有权提前通知用人单位解除劳动合同。通常，提前三十日以书面形式通知用人单位，即可解除劳动合同。
• 借调特殊情况：在借调期间辞职，虽然法律上并未特别规定，但应考虑到借调协议的内容以及原单位和新单位的意见。如果借调协议中有关于辞职的特别约定，应遵守这些约定。

3. 辞职后的处理

• 工作交接：无论是在原单位还是新单位，辞职前都应做好工作交接，确保工作的连续性和稳定性。
• 经济补偿：如果辞职是因为用人单位（原单位或新单位，视具体情况而定）的过错，如未提供劳动条件、未及时支付劳动报酬等，您可能有权要求经济补偿。但如果是个人原因辞职，则通常无权要求经济补偿。
• 社保和档案转移：辞职后，应确保社保和档案的顺利转移，避免影响后续的就业和社保待遇。

4. 实际操作建议

• 与原单位沟通：在决定辞职前，最好与原单位进行充分沟通，了解辞职的具体流程和注意事项。
• 查看借调协议：仔细查看借调协议，了解其中是否有关于辞职的特别约定，以及这些约定是否合法有效。
• 书面辞职通知：无论决定何时辞职，都应提前以书面形式通知用人单位，并保留好相关证据，以备不时之需。

5. 可能的法律后果

• 如果合法辞职：按照法律规定和合同约定办理辞职手续，通常不会产生法律后果。
• 如果违法辞职：如未提前通知或未按照合同约定办理辞职手续，可能会面临用人单位的追责，如要求赔偿损失等。

总结与建议：借调到新单位工作后再辞职是合法的，但具体操作时需考虑劳动合同关系、借调协议的内容以及原单位和新单位的意见。在决定辞职前，建议与原单位进行充分沟通，并仔细查看借调协议和劳动合同的相关规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。